KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序跟一代測(cè)序相比有什么優(yōu)點(diǎn)呢?一代測(cè)序:1.數(shù)據(jù)質(zhì)量,套峰,雙峰等情況,需要人工分析校對(duì)。2.測(cè)序長(zhǎng)度,1 kb。3.成本,低。4.樣本用量,100 ng。5.精確度,70-90%。6.測(cè)序能力,需要測(cè)序引物,只能測(cè)測(cè)序引物間的片段序列。7.通量低,(與讀長(zhǎng)有關(guān))。8.實(shí)驗(yàn)周期,如果片段長(zhǎng)度超過(guò)5K,測(cè)通可能需要15天左右。對(duì)于測(cè)序長(zhǎng)度較長(zhǎng),如果我們用Sanger測(cè)序往往需要花費(fèi)大量的時(shí)間,而我們KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序則只需要5-7天,就可以測(cè)通片段長(zhǎng)度小于30kb以下的片段。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序?qū)τ跇颖镜牧浚蟮囊脖容^少,比如質(zhì)粒我們的樣本要求DNA的濃度需≥ 1 ng/μl, 體積需≥5 μl,如果比較珍貴的樣本或者是樣本比較難提取的,KBSeq就更為適合了。DNA樣品建議用藍(lán)冰運(yùn)輸。上海宏基因組高通量測(cè)序公司
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序技術(shù)可以檢測(cè)復(fù)雜組織中單個(gè)細(xì)胞不同的生物學(xué)特性,這可以極大的幫助我們進(jìn)一步了解細(xì)胞與細(xì)胞之間的差異。"這幾乎就像通過(guò)幾顆星星看到了整個(gè)宇宙。"哈佛大學(xué)分子和細(xì)胞生物學(xué)教授 Alexander Schier的這句話應(yīng)用在這里也是很合適了。這幅圖正是來(lái)自于在2018年4月 Science 雜志發(fā)表的三篇[8-10]來(lái)自哈佛醫(yī)學(xué)院和哈佛大學(xué)的研究人員關(guān)于單細(xì)胞基因測(cè)序文章中的一幅結(jié)果圖,Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。這幾篇文章使用多種檢測(cè)技術(shù)組合,其中包括對(duì)數(shù)千個(gè)發(fā)育中的斑馬魚(yú)和青蛙胚胎單細(xì)胞測(cè)序,在胚胎發(fā)育建議初的24小時(shí)內(nèi)追蹤單個(gè)細(xì)胞的發(fā)育情況,可以揭示出胚胎細(xì)胞何時(shí)何地轉(zhuǎn)變?yōu)樾碌募?xì)胞狀態(tài)和類型并向我們展示了組織和整個(gè)機(jī)體從單細(xì)胞發(fā)育的完整歷程。上海ITS高通量測(cè)序NGS組織材料樣品(提取RNA用),請(qǐng)預(yù)先用液氮速凍,然后轉(zhuǎn)移到干冰中運(yùn)輸。
16s/18s/ITS微生物分類測(cè)序,項(xiàng)目介紹:環(huán)境微生物是自然界中分布建議廣、種類建議多、數(shù)量比較大的生物類群,其群落結(jié)構(gòu)及多樣性和微生物的功能及代謝機(jī)理是微生物生態(tài)學(xué)的研究熱點(diǎn),對(duì)于我們研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、環(huán)境治理和微生物資源的利用以及人類醫(yī)療健康有著重要的理論和現(xiàn)實(shí)意義。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展以及大量序列數(shù)據(jù)的積累,通用引物擴(kuò)增結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù),可以快速檢索環(huán)境內(nèi)微生物的群落結(jié)構(gòu)。這項(xiàng)運(yùn)用我們稱之為微生物分類測(cè)序。如Illumina公司的MiSeq高通量測(cè)序平臺(tái)不僅可實(shí)現(xiàn)對(duì)多樣品的多個(gè)可變區(qū)同時(shí)測(cè)序,而且在測(cè)序速度和測(cè)序通量上都有進(jìn)一步提升,目前此平臺(tái)已在微生物多樣性群落結(jié)構(gòu)研究方面受到了廣大學(xué)者的認(rèn)可。
生工CHIP-Seq,項(xiàng)目介紹:CHIP-SEQ 技術(shù),即染色質(zhì)免疫共沉淀與高通量測(cè)序相結(jié)合的技術(shù)。它是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA 相互作用的有力工具,還可以用來(lái)研究轉(zhuǎn)錄因子與基因表達(dá)的關(guān)系。通過(guò)高通量測(cè)序,可以一次性得到目的蛋白在整個(gè)基因組上的結(jié)合分布,得到目的蛋白精確的結(jié)合位點(diǎn)以及結(jié)合基序等信息。ChIP-Seq 的原理:首先通過(guò)染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA 的所屬片段,并對(duì)其進(jìn)行純化與文庫(kù)構(gòu)建;然后對(duì)富集得到的DNA的片段進(jìn)行高通量測(cè)序,將獲得的數(shù)百萬(wàn)條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。X儀器本身有16個(gè)通道(Controller為8通道),每個(gè)通道極限多捕獲20000個(gè)細(xì)胞(Controller為10000個(gè)細(xì)胞) 。
全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Total RNA-Seq),項(xiàng)目介紹:全轉(zhuǎn)錄組是指特定細(xì)胞在特定狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA(non-coding RNA)。針對(duì)非編碼RNA的研究主要集中在具有調(diào)控作用的miRNA,lncRNA和circRNA?;诙鷾y(cè)序技術(shù)的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究,同時(shí)分析同一樣本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通過(guò)關(guān)聯(lián)分析,使研究?jī)?nèi)容更加系統(tǒng)化,致力于深入挖掘生命現(xiàn)象背后的轉(zhuǎn)錄調(diào)控問(wèn)題。組織樣品或者總 RNA, 樣品名稱清晰,干冰運(yùn)輸。Illumina HiSeq2500/4000 可以運(yùn)行PE150/PE250模式。上海無(wú)參轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序服務(wù)
RNA樣品建議用足量干冰運(yùn)輸。上海宏基因組高通量測(cè)序公司
生工外顯子測(cè)序,項(xiàng)目介紹:已知人類基因組上有180000個(gè)外顯子,占整個(gè)基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負(fù)責(zé)編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復(fù)雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測(cè) 序,全外顯子捕獲測(cè)序有測(cè)序深度高、價(jià)格便宜的優(yōu)勢(shì),性價(jià)比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行深度測(cè)序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測(cè),形成完整的分析報(bào)告。上海宏基因組高通量測(cè)序公司
生工生物工程(上海)股份有限公司在同行業(yè)領(lǐng)域中,一直處在一個(gè)不斷銳意進(jìn)取,不斷制造創(chuàng)新的市場(chǎng)高度,多年以來(lái)致力于發(fā)展富有創(chuàng)新價(jià)值理念的產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn),在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的商業(yè)口碑,成績(jī)讓我們喜悅,但不會(huì)讓我們止步,殘酷的市場(chǎng)磨煉了我們堅(jiān)強(qiáng)不屈的意志,和諧溫馨的工作環(huán)境,富有營(yíng)養(yǎng)的公司土壤滋養(yǎng)著我們不斷開(kāi)拓創(chuàng)新,勇于進(jìn)取的無(wú)限潛力,生工生物工程供應(yīng)攜手大家一起走向共同輝煌的未來(lái),回首過(guò)去,我們不會(huì)因?yàn)槿〉昧艘稽c(diǎn)點(diǎn)成績(jī)而沾沾自喜,相反的是面對(duì)競(jìng)爭(zhēng)越來(lái)越激烈的市場(chǎng)氛圍,我們更要明確自己的不足,做好迎接新挑戰(zhàn)的準(zhǔn)備,要不畏困難,激流勇進(jìn),以一個(gè)更嶄新的精神面貌迎接大家,共同走向輝煌回來(lái)!