iTRAQ定量蛋白組學技術：iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)定量蛋白質(zhì)組學技術多肽體外標記定量技術。這種技術同TMT定量蛋白組學技術相似，可研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品...

定量蛋白質(zhì)組學的方法學背景意義：從生命活動的直接執(zhí)行者——蛋白質(zhì)的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織中含有蛋白質(zhì)種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質(zhì)表達水平變化的研究，...

定量磷酸化蛋白質(zhì)翻譯修飾組學：蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化是重要的翻譯后修飾，它與信號傳導、細胞周期、生長發(fā)育機理等諸多生物學問題有密切關系。研究蛋白質(zhì)磷酸化對闡明蛋白質(zhì)功能具有重要意義。將磷酸化肽段TiO2富集技術和iTRAQ/TMT/Lable free技術相結合，實...

單細胞轉(zhuǎn)錄組學技術：10×genomics技術：首先在凝膠微珠上種上特定的DNA的片段，DNA的片段由三部分組成：Barcode、UMI、PolyT組成。Barcode是16個堿基的長度。一共有400萬種Barcode，一個微珠是對應于一種Barcode，通過...

代謝組學究竟是一門什么樣的研究方向？首先定義什么是代謝組學。簡單的說就是研究生物體對內(nèi)外刺激的整體代謝應答規(guī)律。那么為什么代謝組學是基因組，轉(zhuǎn)錄組，蛋白質(zhì)組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向，的執(zhí)行者蛋白質(zhì)中很多酶參與了體內(nèi)的代...

蛋白組學樣本要求：常規(guī)組織：（心、肝、脾、肺、腎、腸、腦、肌肉等）PBS洗滌去除殘留血液和污染物，剔除無關的干擾組織（血管、脂肪、結締組織等）；沖洗干凈，用組織剪或手術刀將組織分離成1cm3左右的小塊；液氮速凍5min，保存于-80℃。軟骨組織：PBS洗滌去除...

磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學服務：蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性，以及磷酸基團的供體ATP的易得性，使得磷酸化修飾被真核細胞所選擇接受成為一種比較普遍的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程，幾...

LabelFree(非標記蛋白質(zhì)組學技術)：應用：1.需要快速在大量樣本中找到差異表達的蛋白組合。2.需要在較短時間以較低成本得到具有提示意義的蛋白表達數(shù)據(jù)。3.需要檢測的樣品蛋白含量低。4.需要檢測相互作用蛋白。技術特點：1.對質(zhì)譜儀器設備要求較高，色譜和質(zhì)...

轉(zhuǎn)錄組學(transcriptomics)是功能基因組學(FunctionalGenomics)研究的重要組成部分，是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學科。隨著人類基因組計劃HGP(HumanGenomeProject)的完成，科學家也逐...

蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容：1.蛋白質(zhì)鑒定：可以利用一維電泳和二維電泳并結合相關技術，利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術對蛋白質(zhì)進行鑒定研究。2.翻譯后修飾：很多mRNA表達產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)功能的...

LabelFree(非標記蛋白質(zhì)組學技術)：在非標記策略的定量模型中，主要涉及兩種不同的算法：其一，以肽段的色譜峰積分面積為基礎，通過比較一對生物樣品中相對應到蛋白質(zhì)酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對豐度；其二，以肽段被質(zhì)譜檢測的計數(shù)為基礎，通過歸一化來表...

PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學實驗原理：PRM技術是一種根據(jù)已知實測信息或質(zhì)譜檢測規(guī)律的假定信息對樣品中的蛋白質(zhì)進行靶向定量的技術。該技術主要應用儀器為Q Exactive系列質(zhì)譜儀，首先以四極桿作為質(zhì)量過濾器，特異性地選擇與預先設定質(zhì)荷比相同的肽段離子（母離子）通...

蛋白質(zhì)磷酸化修飾類型：根據(jù)磷酸氨基酸殘基的不同，可將磷酸化蛋白質(zhì)分為4類，即O-磷酸鹽蛋白質(zhì)、N-磷酸鹽蛋白質(zhì)、?；姿猁}蛋白質(zhì)和S-磷酸鹽蛋白質(zhì)。1、O-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過羥氨基酸（如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸）的磷酸化形成。2、 N-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過精氨酸、賴氨...

乙?；揎椀鞍捉M學應用方向有什么？1、基礎醫(yī)學、臨床診斷：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治理等；2、生物醫(yī)藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發(fā)等；3、微生物領域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等；4、海洋水產(chǎn)：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)...

磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學：磷酸化修飾蛋白質(zhì)組的研究主要集中于真核生物中普遍存在的絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的磷酸化。由于體內(nèi)磷酸化蛋白的含量很低，因此在分析前必須對其進行分離和富集。目前，常用的磷酸化蛋白質(zhì)的分離和富集技術包括固定化金屬親和色譜、免疫沉淀、強陽離子交換...

蛋白質(zhì)組學應用領域：1.蛋白質(zhì)鑒定：能夠應用一維電泳和二維電泳并分離相關的技術，應用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及共沉淀等技術對蛋白質(zhì)停止審定研討。2.修飾：很多mRNA表達產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要閱歷后修飾如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。修飾是蛋白質(zhì)調(diào)理功用的重要方式，因而對蛋...

定量蛋白質(zhì)組學方法學介紹：iTRAQ：iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學應用比較普遍的技術，該技術的關鍵原理是多肽標記和定量，將多肽的含量轉(zhuǎn)化為114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8標記...

蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學技術：乙?；揎検求w內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對細胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。此外，還存在大量的非組蛋白乙酰化修飾參與了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。乙?；揎椊M學技術服務采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙酰化鑒定的影...

circRNA轉(zhuǎn)錄組學：是一類具有閉合環(huán)狀結構的非編碼RNA分子，沒有5′ 帽子結構和3′ poly（A）結構，主要位于細胞質(zhì)或儲存于外泌體中，不受RNA外切酶影響，表達更穩(wěn)定且不易降解，已被證明普遍存在于多種真核生物體內(nèi)。大多數(shù)circRNA是由外顯子環(huán)化而...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾：蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結合，調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡中發(fā)揮著重要的作用，翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導致一系列疾病的發(fā)生。通過實驗的方法鑒...

circRNA轉(zhuǎn)錄組學：是一類具有閉合環(huán)狀結構的非編碼RNA分子，沒有5′帽子結構和3′poly（A）結構，主要位于細胞質(zhì)或儲存于外泌體中，不受RNA外切酶影響，表達更穩(wěn)定且不易降解，已被證明普遍存在于多種真核生物體內(nèi)[1]。大多數(shù)circRNA是由外顯子環(huán)化...

轉(zhuǎn)錄組學應用領域：海洋水產(chǎn)：生長發(fā)育機制，漁業(yè)資源，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等；微生物：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等；生物醫(yī)藥：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，藥物開發(fā)，個性化醫(yī)治等；環(huán)境科學：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危害風險評估研究...

我們究竟怎么研究蛋白質(zhì)組學呢？抗體免疫的方法呢，其實就是ELISA，Western及蛋白質(zhì)芯片。通過合成大量蛋白質(zhì)特異的抗體，能夠進行定性檢測及相對定量分析，只要你有好用的抗體，那么就可以通過免疫反應讓抗體快速的識別你感興趣的蛋白質(zhì)，然后用例如HRP發(fā)光等標記...

蛋白質(zhì)糖基化修飾組學技術服務：糖基化是在酶的控制下,蛋白質(zhì)或脂質(zhì)附加上糖類的過程,發(fā)生于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體等部位。在糖基轉(zhuǎn)移酶作用下將糖轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì),和蛋白質(zhì)上的氨基酸殘基共價結合。蛋白質(zhì)經(jīng)過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)功...

蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的主要機制之一,在DNA損傷修復,自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導致疾病的發(fā)生.在蛋白質(zhì)的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙?；?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這...

蛋白質(zhì)組學常用技術：非靶向蛋白組學：蛋白質(zhì)定性（膠條鑒定和溶液鑒定），高通量定量蛋白組（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽組學。蛋白質(zhì)組研究技術在研究對象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。蛋白質(zhì)組學主要以全蛋白組（組織...

代謝組學的研究對象與層次有哪些？一般來說，代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對象和目的不同，科學家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個層次：代謝物靶標分析：某一個或幾個特定組分的定性和定量分析，如某一類結構、性質(zhì)相關的化合物（氨基酸...

轉(zhuǎn)錄組學測序流程：1、樣品RNA準備。2、測序文庫構建。3、DNA成簇(Cluster)擴增。4、高通量測序(Illumina)。5、數(shù)據(jù)分析。轉(zhuǎn)錄組的分析大致有以下幾種情況：1、同一物種在發(fā)育過程中的各時間節(jié)點的基因表達特點及存在的差異；2、不同品系之間存在...

蛋白質(zhì)磷酸化修飾類型：根據(jù)磷酸氨基酸殘基的不同，可將磷酸化蛋白質(zhì)分為4類，即O-磷酸鹽蛋白質(zhì)、N-磷酸鹽蛋白質(zhì)、酰基磷酸鹽蛋白質(zhì)和S-磷酸鹽蛋白質(zhì)。1、O-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過羥氨基酸（如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸）的磷酸化形成。2、 N-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過精氨酸、賴氨...

代謝組學有哪些特點？(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學的末端，更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實情況，因此，在多數(shù)生物表型研究上更加適用。(2) 常規(guī)代謝組學只關注內(nèi)源性化合物，也有使用代謝組學技術測定外源性化合物的。內(nèi)源性化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病、毒性、基因修飾...