全質(zhì)粒測(cè)序高通量測(cè)序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-11

真核/原核無參mRNA-Seq,項(xiàng)目介紹;測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái),測(cè)序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進(jìn)行拼接,并進(jìn)一步對(duì)拼接所得轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋、CDD、CDS分析,SNP分析,SSR標(biāo)記開發(fā)等分析。在計(jì)算基因的表達(dá)量后,進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對(duì)于多個(gè)樣本,可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外,還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。 組織材料樣品(提取RNA用),請(qǐng)預(yù)先用液氮速凍,然后轉(zhuǎn)移到干冰中運(yùn)輸。全質(zhì)粒測(cè)序高通量測(cè)序

樣本寄送時(shí),請(qǐng)將填寫完整的紙質(zhì)版《高通量測(cè)序送樣表》密封于塑料袋內(nèi),隨樣本一起寄出,紙質(zhì)版的樣本信息單用于樣本接收人員在收到樣本后及時(shí)并正確的保存并錄入樣本,如無紙質(zhì)版的樣本信息單可能會(huì)延誤項(xiàng)目周期;樣本管壁或管蓋上標(biāo)明的樣本名稱需要與《高通量測(cè)序送樣表》里樣本名稱一致,這樣可以避免我們收到樣本后與您確認(rèn)樣本編號(hào)而耽誤樣本質(zhì)檢、提取實(shí)驗(yàn);如有特殊情況,請(qǐng)?jiān)凇陡咄繙y(cè)序送樣表》中注明;樣品編號(hào)請(qǐng)避免使用中文、羅馬數(shù)字、“-”以及特殊符號(hào)標(biāo)示,避免分析的時(shí)候系統(tǒng)無法識(shí)別,導(dǎo)致分析無法完成;我們分析人員建議編號(hào)可以采用英文字母與阿拉伯?dāng)?shù)字結(jié)合的形式,字符比較好不要過長,避免繪制部分分析圖的時(shí)候難以全部展示。上海靶向捕獲高通量測(cè)序平臺(tái)請(qǐng)注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。

細(xì)胞質(zhì)檢時(shí)染料染色的原理:臺(tái)盼藍(lán)染色原理:臺(tái)盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一種小分子染料,可以通過完整的細(xì)胞膜,嵌入所有細(xì)胞(活細(xì)胞和死細(xì)胞)的細(xì)胞核,呈現(xiàn)綠色熒光;碘化丙啶(PI)只能通過不完整的細(xì)胞膜,即死細(xì)胞的細(xì)胞膜,嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核,呈現(xiàn)紅色熒光,通過標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞,這種特異性染色的方法也可以排除無核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。

通過顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢能觀察到懸液背景質(zhì)量和細(xì)胞數(shù)目及活性的評(píng)估。讓我們?cè)賮砘仡櫼幌屡_(tái)盼藍(lán)染色原理:臺(tái)盼藍(lán)染色原理:臺(tái)盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。怎樣通過血球計(jì)數(shù)板進(jìn)行質(zhì)檢操作呢?將血球計(jì)數(shù)板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計(jì)數(shù)板上;將細(xì)胞懸液混勻(或10μl臺(tái)盼藍(lán)+10μl細(xì)胞懸液),吸出10μl懸液至計(jì)數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細(xì)胞核懸液鋪滿蓋玻片和計(jì)數(shù)板之間;在顯微鏡下分別對(duì)V1/V2/V3/V4四個(gè)計(jì)數(shù)區(qū)域進(jìn)行計(jì)數(shù);按細(xì)胞計(jì)數(shù)公式進(jìn)行計(jì)算,計(jì)算公式:細(xì)胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數(shù),V1/V2/V3/V4為各個(gè)計(jì)數(shù)區(qū)的細(xì)胞數(shù)目,細(xì)胞活率=活細(xì)胞數(shù)目/總細(xì)胞數(shù)目*100%。請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運(yùn)輸,不超過3天。

生工高通量測(cè)序樣品要求,環(huán)境樣品:如果是新鮮土壤/污泥樣品,可以以冰袋運(yùn)輸,不超過3天;如果是凍存過的樣品(-20°C或者-80°C冰箱保存),為避免反復(fù)凍融,建議用足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗(yàn),在秋冬季節(jié),如果打包合適,3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí))寄送;如果是水體樣品,建議采用濾膜過濾后,將濾膜寄送來生工。生工不負(fù)責(zé)過濾。要求濾膜3張,冰袋運(yùn)輸,不超過3天。其余特殊環(huán)境樣品,具體咨詢生工高通量測(cè)序部。

DNA樣品:請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運(yùn)輸,不超過3天。 目前,生工生物已開展10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)服務(wù),如果正好您有需要,那就快快來call我們吧!上海16s高通量測(cè)序NGS

寄送 RNA 樣品請(qǐng)置于 1.5 ml 離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時(shí)間,管口使用 Parafilm 封口。全質(zhì)粒測(cè)序高通量測(cè)序

16s/18s/ITS微生物分類測(cè)序,項(xiàng)目介紹:環(huán)境微生物是自然界中分布建議廣、種類建議多、數(shù)量比較大的生物類群,其群落結(jié)構(gòu)及多樣性和微生物的功能及代謝機(jī)理是微生物生態(tài)學(xué)的研究熱點(diǎn),對(duì)于我們研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、環(huán)境治理和微生物資源的利用以及人類醫(yī)療健康有著重要的理論和現(xiàn)實(shí)意義。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展以及大量序列數(shù)據(jù)的積累,通用引物擴(kuò)增結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù),可以快速檢索環(huán)境內(nèi)微生物的群落結(jié)構(gòu)。這項(xiàng)運(yùn)用我們稱之為微生物分類測(cè)序。如Illumina公司的MiSeq高通量測(cè)序平臺(tái)不僅可實(shí)現(xiàn)對(duì)多樣品的多個(gè)可變區(qū)同時(shí)測(cè)序,而且在測(cè)序速度和測(cè)序通量上都有進(jìn)一步提升,目前此平臺(tái)已在微生物多樣性群落結(jié)構(gòu)研究方面受到了廣大學(xué)者的認(rèn)可。全質(zhì)粒測(cè)序高通量測(cè)序

生工生物工程(上海)股份有限公司位于香閔路698號(hào)。公司業(yè)務(wù)涵蓋生化試劑,實(shí)驗(yàn)耗材,實(shí)驗(yàn)試劑,研發(fā)等,價(jià)格合理,品質(zhì)有保證。公司將不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競爭力,努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識(shí),遵守行業(yè)規(guī)范,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。生工生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點(diǎn)競爭力。

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