真核/原核有參mRNA-Seq，項目介紹：轉(zhuǎn)錄組（transcriptome）廣義上指某一生理條件下，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的gather，狹義上指所有mRNA的gather。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達的主要手段，是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式，通過轉(zhuǎn)錄組測序分析轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控，是目前運用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺，測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后，mapping至參考基因組序列，對mapping到基因上的reads進行計數(shù)，計算基因的表達量后，進行基因表達差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對于多個樣本，可進行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外，依據(jù)參考基因組，可進行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗證性分析；可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進行關(guān)聯(lián)分析等分析。另外，還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析，深入研究基因功能，進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息，為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機理提供方向。PacBio Sequel/RSII 該測序平臺主要承接細(xì)菌基因組完成圖測序、fungus基因組精細(xì)圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序服務(wù)。上海市多重擴增高通量測序技術(shù)
生工高通量測序樣品要求，組織/細(xì)胞樣品：請使用新鮮取樣的實驗材料，當(dāng)場分成小塊后立即用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C冰箱，用足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時）寄送;于微生物樣品，請客戶如實聲明所屬物種，對于可能致病的微生物，生工保留拒收的權(quán)利;對于需要進行RNA抽提的樣品，可以但不建議將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送，具體情況請先取得溝通。上海地區(qū)宏基因組高通量測序請注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本，盡量避免RNA降解。
臺盼藍(lán)染色原理：臺盼藍(lán)染色原理：臺盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。
通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果：明場（細(xì)胞未染色）：主要可以觀察懸液背景質(zhì)量（背景干凈，無雜質(zhì)碎片，無細(xì)胞團塊）；臺盼藍(lán)場（細(xì)胞與臺盼藍(lán)染色后）：主要可以觀察活性（主要為活細(xì)胞，未染色藍(lán)色的為活細(xì)胞）；通過臺盼藍(lán)場計算活率：90%>80%；細(xì)胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來看，血球計數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標(biāo)均符合上機標(biāo)準(zhǔn)，屬于高質(zhì)量單細(xì)胞懸液。
生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗，日均處理樣品200余例，涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細(xì)胞等樣品，省去您處理樣品的繁瑣過程。生物信息分析經(jīng)驗豐富，可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容（以生工分析報告模板為準(zhǔn)），全部free。生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系，可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目，一站式解決問題。同時生工生物單細(xì)胞團隊目前已同時擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺，可為您提供超高通量和低通量單細(xì)胞樣本雙重。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序指在單細(xì)胞水平上對 mRNA 進行高通量測序和分析的技術(shù)。
高通量測序技術(shù)是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。在基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運用。生工生物工程（上海）股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來，逐步引進了Illumina，Life，PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實驗室（通過了國家ISO認(rèn)證）以及10PB級運算能力的服務(wù)器集群，能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時，生工高通量測序團隊建設(shè)也在不斷完善中，目前有50余專職員工，其中高級技術(shù)人員以及高級生物信息工程師占比50%以上，5年來，通過生工高通量測序結(jié)果發(fā)表的文章累計影響因子超過1000分以上。特別申明：不能采用過柱離心的方法提取總RNA。上海地區(qū)ITS高通量測序原理
近年來，隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展和普及，單細(xì)胞測序技術(shù)發(fā)展十分迅速。上海市多重擴增高通量測序技術(shù)
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序中，制備高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液至關(guān)重要。而懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細(xì)胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運作的呢？單細(xì)胞懸液質(zhì)控要求：?細(xì)胞濃度：700-1200cells/μl；?細(xì)胞活率>80%（當(dāng)細(xì)胞懸液活率低于70%時建議進行去除死細(xì)胞處理）；細(xì)胞團及碎片雜質(zhì)<5%（無細(xì)胞粘連，無明顯的細(xì)胞碎片和細(xì)胞團，并保證細(xì)胞的完整性）；?細(xì)胞狀態(tài)：細(xì)胞直徑在7-40um之間（細(xì)胞直徑過大則建議進行抽核處理）；?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細(xì)胞的核酸分子。上海市多重擴增高通量測序技術(shù)
生工生物工程（上海）股份有限公司是一家有著雄厚實力背景、信譽可靠、勵精圖治、展望未來、有夢想有目標(biāo)，有組織有體系的公司，堅持于帶領(lǐng)員工在未來的道路上大放光明，攜手共畫藍(lán)圖，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠的客戶粉絲源，也收獲了良好的用戶口碑，為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ)，也希望未來公司能成為*****，努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻出自己的一份力量，我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強不息，斗志昂揚的的企業(yè)精神將**生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌，共創(chuàng)佳績，一直以來，公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠實守信的方針，員工精誠努力，協(xié)同奮取，以品質(zhì)、服務(wù)來贏得市場，我們一直在路上！