small RNA測(cè)序，項(xiàng)目簡(jiǎn)介：Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子，長(zhǎng)度在18-30 nt之間，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默，參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控，從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)、分化，以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過(guò)程。高通量測(cè)序技術(shù)可以對(duì)樣本中所有small RNA家族進(jìn)行測(cè)序和表達(dá)定量，從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái)，測(cè)序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后，進(jìn)行Clean reads 長(zhǎng)度分布統(tǒng)計(jì)，small RNA注釋，已知 miRNA 注釋，已知piRNA注釋，ncRNA分析，新 miRNA 預(yù)測(cè)（有參考基因組），差異基因可視化分析，miRNA 家族分析，差異表達(dá) miRNA 聚類分析，miRNA靶基因預(yù)測(cè)，靶基因GO、KEGG富集分析。生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富，可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。上海宏基因組高通量測(cè)序NGS
對(duì)于細(xì)胞樣品，送樣量需達(dá)到 5 × 106（5乘10的6次方）數(shù)量級(jí)。富集后置于 2 ml Ep管中，用 1 ml TRIzol 重懸，注意取樣后立即用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C 冰箱，埋于足量的干冰中用保溫箱寄送。強(qiáng)烈建議細(xì)胞樣品先做細(xì)胞鑒定及支原體/衣原體污染之后，再送出來(lái)。對(duì)于血液樣本，只接收未凍存過(guò)的抗凝血新鮮樣本。抗凝劑不可使用肝素鈉，可用EDTA或ACD抗凝劑，取血后以冰袋保存，切記不能使血液凍結(jié)，從取血之時(shí)開(kāi)始計(jì)算，須在48小時(shí)之內(nèi)送達(dá)生工上?？偛扛咄繙y(cè)序部。如果不能提供新鮮樣本，則請(qǐng)?zhí)峁难褐刑崛〉目俁NA樣本。備樣要求詳見(jiàn)B、RNA 樣品。上海18s高通量測(cè)序產(chǎn)品PacBio Sequel/RSII 該測(cè)序平臺(tái)讀長(zhǎng)超長(zhǎng)，平均可達(dá)10 kb以上。
全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（Total RNA-Seq），項(xiàng)目介紹：全轉(zhuǎn)錄組是指特定細(xì)胞在特定狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA（non-coding RNA）。針對(duì)非編碼RNA的研究主要集中在具有調(diào)控作用的miRNA，lncRNA和circRNA。基于二代測(cè)序技術(shù)的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究，同時(shí)分析同一樣本中的mRNA，lncRNA，circRNA和miRNA，并且通過(guò)關(guān)聯(lián)分析，使研究?jī)?nèi)容更加系統(tǒng)化，致力于深入挖掘生命現(xiàn)象背后的轉(zhuǎn)錄調(diào)控問(wèn)題。組織樣品或者總 RNA， 樣品名稱清晰，干冰運(yùn)輸。
生工人、大、小鼠全基因組測(cè)序，項(xiàng)目介紹：人或者大、小鼠全部基因組重測(cè)序，研究其突變信息（包括SNP/InDel/CNV/SV），并注釋突變位點(diǎn)信息。該技術(shù)可同時(shí)獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息，被廣泛應(yīng)用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測(cè)序平臺(tái)：HiSeq XTen平臺(tái)進(jìn)行PE150測(cè)序。生工微生物基因組測(cè)序，項(xiàng)目介紹：微生物基因組重測(cè)序（有參）目前越來(lái)越多的微生物基因組被解析出來(lái)了。從而使得科研工作者們可以對(duì)某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)有參考基因組微生物進(jìn)行多個(gè)體的基因組重測(cè)序，精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序指在單細(xì)胞水平上對(duì) mRNA 進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù)。
生工高通量測(cè)序樣品要求，環(huán)境樣品：如果是新鮮土壤/污泥樣品，可以以冰袋運(yùn)輸，不超過(guò)3天;如果是凍存過(guò)的樣品（-20°C或者-80°C冰箱保存），為避免反復(fù)凍融，建議用足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗(yàn)，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí)）寄送;如果是水體樣品，建議采用濾膜過(guò)濾后，將濾膜寄送來(lái)生工。生工不負(fù)責(zé)過(guò)濾。要求濾膜3張，冰袋運(yùn)輸，不超過(guò)3天。其余特殊環(huán)境樣品，具體咨詢生工高通量測(cè)序部。
DNA樣品：請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖，濃度>20 ng/μl，總量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA，可冰袋運(yùn)輸，不超過(guò)3天。 請(qǐng)注意選擇無(wú)RNA酶的容器盛放樣本，盡量避免RNA降解。18s高通量測(cè)序高通量
Illumina HiSeq2500/4000 可以運(yùn)行PE150/PE250模式。上海宏基因組高通量測(cè)序NGS
長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)測(cè)序(只限有參考基因組物種)，項(xiàng)目介紹：長(zhǎng)鏈非編碼RNAs（Long non-coding RNAs，LncRNAs）是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度大于200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAs（不含rRNA），普遍存在于各種生物體內(nèi)。哺乳動(dòng)物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是LncRNA（相應(yīng)的蛋白編碼RNA比例是1%）。近年來(lái)研究表明，LncRNA參與了多種重要的調(diào)控過(guò)程，如X染色體沉默、基因組印記及染色質(zhì)修飾等。通過(guò)LncRNA測(cè)序，可以快速獲得與其生物學(xué)過(guò)程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達(dá)變化，從而促進(jìn)LncRNA的深入研究。上海宏基因組高通量測(cè)序NGS
生工生物工程（上海）股份有限公司是一家有著先進(jìn)的發(fā)展理念，先進(jìn)的管理經(jīng)驗(yàn)，在發(fā)展過(guò)程中不斷完善自己，要求自己，不斷創(chuàng)新，時(shí)刻準(zhǔn)備著迎接更多挑戰(zhàn)的活力公司，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中匯聚了大量的人脈以及**，在業(yè)界也收獲了很多良好的評(píng)價(jià)，這些都源自于自身不努力和大家共同進(jìn)步的結(jié)果，這些評(píng)價(jià)對(duì)我們而言是比較好的前進(jìn)動(dòng)力，也促使我們?cè)谝院蟮牡缆飞媳３謯^發(fā)圖強(qiáng)、一往無(wú)前的進(jìn)取創(chuàng)新精神，努力把公司發(fā)展戰(zhàn)略推向一個(gè)新高度，在全體員工共同努力之下，全力拼搏將共同生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手走向更好的未來(lái)，創(chuàng)造更有價(jià)值的產(chǎn)品，我們將以更好的狀態(tài)，更認(rèn)真的態(tài)度，更飽滿的精力去創(chuàng)造，去拼搏，去努力，讓我們一起更好更快的成長(zhǎng)！