擴增子測序，項目介紹：隨著基因編輯技術（尤其是CRISPR-cas9技術）的發(fā)展，科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測序技術無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是，通過對靶基因區(qū)域附近設計引物，進行PCR擴增，并對PCR產(chǎn)物進行高通量測序，可以快速高效的獲得目標區(qū)域的突變頻率信息，尤其是對低頻突變的檢測效果遠遠優(yōu)于一代測序，性價比極高。16S全長分類測序，項目介紹：16S全長測序分析主要是對 16S rRNA基因全長進行擴增，基于PacBio 測序平臺測序. 相比較二代測序只選擇 1-2 個高變區(qū)進行測序，三代可以獲得全長的 16S 序列，更多變異區(qū)信息可以提高物種鑒定的分辨率，還可以提高對于群落組成的鑒定的精度。另外，針對fungus/真核生物，也可以采用類似的辦法，擴增ITS/18S全長，進行物種分類測序，提高鑒定精度。Illumina HiSeq2500/4000 可以運行PE150/PE250模式。上海SNP高通量測序應用
真核/原核無參mRNA-Seq，項目介紹；測序使用Illumina Xten平臺，測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進行拼接，并進一步對拼接所得轉錄本進行功能注釋、CDD、CDS分析，SNP分析，SSR標記開發(fā)等分析。在計算基因的表達量后，進行基因表達差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對于多個樣本，可進行重復相關性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外，還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡互作等分析，深入研究基因功能，進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡等信息，為研究網(wǎng)絡調(diào)控機理提供方向。 無參轉錄組高通量測序項目現(xiàn)在也有學者為了區(qū)分傳統(tǒng)測序和單細胞測序的區(qū)別，將傳統(tǒng)方法稱為批量測序。
簡化基因組測序，項目介紹：通過限制性內(nèi)切酶對基因組DNA進行酶切，并對酶切片段進行高通量測序，這種通過酶切降低基因組的復雜度的測序技術統(tǒng)稱為簡化基因 組測序技術。利用生物信息學方法，進行SNP單體型圖譜繪制，全基因組關聯(lián)分析（GWAS），連鎖分析和QTL定位分析，種群進化，主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測序，項目介紹：宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA，隨后進行大規(guī)模高通量測序（shotgun 策 略）。測到數(shù)據(jù)后，先進行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控，而后進行基因組拼接、注釋（物種、基因功能），使得我們可以獲取環(huán)境樣品內(nèi)菌群分布、系統(tǒng)進化、功能代謝等信息。該方法已經(jīng)得到普遍的運用。
真核/原核有參mRNA-Seq，項目介紹：轉錄組（transcriptome）廣義上指某一生理條件下，細胞內(nèi)所有轉錄產(chǎn)物的gather，狹義上指所有mRNA的gather。轉錄組是研究基因表達的主要手段，是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式，通過轉錄組測序分析轉錄水平的調(diào)控，是目前運用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺，測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后，mapping至參考基因組序列，對mapping到基因上的reads進行計數(shù)，計算基因的表達量后，進行基因表達差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對于多個樣本，可進行重復相關性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外，依據(jù)參考基因組，可進行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗證性分析；可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉錄本預測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進行關聯(lián)分析等分析。另外，還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡互作等分析，深入研究基因功能，進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡等信息，為研究網(wǎng)絡調(diào)控機理提供方向。ChIP項目至少要求50ng DNA，以Qubit 2.0檢測為準。其余具體咨詢生工高通量測序部。
懸液制備好后質(zhì)檢結果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細胞懸液質(zhì)檢關卡究竟是怎樣運作的呢？單細胞懸液質(zhì)控要求：?細胞濃度：700-1200cells/μl；?細胞活率>80%（當細胞懸液活率低于70%時建議進行去除死細胞處理）；細胞團及碎片雜質(zhì)<5%（無細胞粘連，無明顯的細胞碎片和細胞團，并保證細胞的完整性）；?細胞狀態(tài)：細胞直徑在7-40um之間（細胞直徑過大則建議進行抽核處理）；?不存在逆轉錄抑制劑和非細胞的核酸分子。Life Ion torrentPGM 運行314、316、318芯片，可以承接擴增子測序、靶區(qū)域測序、基因組重測序服務。上海地區(qū)基因組高通量測序技術
組織材料樣品（提取RNA用）建議將標簽用膠帶貼到管壁，干冰運輸。上海SNP高通量測序應用
全轉錄組測序（Total RNA-Seq），項目介紹：全轉錄組是指特定細胞在特定狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA（non-coding RNA）。針對非編碼RNA的研究主要集中在具有調(diào)控作用的miRNA，lncRNA和circRNA?；诙鷾y序技術的全轉錄組測序研究，同時分析同一樣本中的mRNA，lncRNA，circRNA和miRNA，并且通過關聯(lián)分析，使研究內(nèi)容更加系統(tǒng)化，致力于深入挖掘生命現(xiàn)象背后的轉錄調(diào)控問題。組織樣品或者總 RNA， 樣品名稱清晰，干冰運輸。上海SNP高通量測序應用
生工生物工程（上海）股份有限公司是一家有著雄厚實力背景、信譽可靠、勵精圖治、展望未來、有夢想有目標，有組織有體系的公司，堅持于帶領員工在未來的道路上大放光明，攜手共畫藍圖，在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠的客戶粉絲源，也收獲了良好的用戶口碑，為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎，也希望未來公司能成為*****，努力為行業(yè)領域的發(fā)展奉獻出自己的一份力量，我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強不息，斗志昂揚的的企業(yè)精神將**生工生物工程供應和您一起攜手步入輝煌，共創(chuàng)佳績，一直以來，公司貫徹執(zhí)行科學管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠實守信的方針，員工精誠努力，協(xié)同奮取，以品質(zhì)、服務來贏得市場，我們一直在路上！