生工外顯子測序,項目介紹:已知人類基因組上有180000個外顯子,占整個基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負責編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測 序,全外顯子捕獲測序有測序深度高、價格便宜的優(yōu)勢,性價比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告。DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子。上海地區(qū)微生物高...
全轉(zhuǎn)錄組測序(Total RNA-Seq),項目介紹:全轉(zhuǎn)錄組是指特定細胞在特定狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA(non-coding RNA)。針對非編碼RNA的研究主要集中在具有調(diào)控作用的miRNA,lncRNA和circRNA?;诙鷾y序技術(shù)的全轉(zhuǎn)錄組測序研究,同時分析同一樣本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通過關(guān)聯(lián)分析,使研究內(nèi)容更加系統(tǒng)化,致力于深入挖掘生命現(xiàn)象背后的轉(zhuǎn)錄調(diào)控問題。組織樣品或者總 RNA, 樣品名稱清晰,干冰運輸。生工一直秉持只要生工已經(jīng)標準化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準),全部無費用。上海轉(zhuǎn)錄組高通...
臺盼藍染色原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。 通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果:明場(細胞未染色):主要可以觀察懸液背景質(zhì)量(背景干凈,無雜質(zhì)碎片,無細胞團塊);臺盼藍場(細胞與臺盼藍染色后):主要可以觀察活性(主要為活細胞,未染色藍色的為活細胞);通過臺盼藍場計算活率:90%>80%;細胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來看,血球計數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標均符合上機標準,屬于高質(zhì)量單細胞懸液。 單細胞測序到底是什么?上海宏基因組高通量測序RNA類高通量...
高通量測序技術(shù)是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。在基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細醫(yī)療檢測領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來,逐步引進了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標準實驗室(通過了國家ISO認證)以及10PB級運算能力的服務器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時,生工高通量測序團隊建設(shè)也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級技術(shù)人員以及高級生物信息工程師占比50%以上,5年來,通過生工高通量測序結(jié)果發(fā)表...
16s/18s/ITS微生物分類測序,項目介紹:環(huán)境微生物是自然界中分布建議廣、種類建議多、數(shù)量比較大的生物類群,其群落結(jié)構(gòu)及多樣性和微生物的功能及代謝機理是微生物生態(tài)學的研究熱點,對于我們研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、環(huán)境治理和微生物資源的利用以及人類醫(yī)療健康有著重要的理論和現(xiàn)實意義。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展以及大量序列數(shù)據(jù)的積累,通用引物擴增結(jié)合高通量測序技術(shù),可以快速檢索環(huán)境內(nèi)微生物的群落結(jié)構(gòu)。這項運用我們稱之為微生物分類測序。如Illumina公司的MiSeq高通量測序平臺不僅可實現(xiàn)對多樣品的多個可變區(qū)同時測序,而且在測序速度和測序通量上都有進一步提升,目前此平臺已在微生物多樣性群落結(jié)構(gòu)研究...
生工人線粒體基因組測序(多重擴增法),項目介紹:生工生物高通量測序部采用多重擴增技術(shù),對人線粒體基因組進行擴增捕獲,并進一步采用Illumina測序平臺進行高通量測序。該技術(shù)方案可以快速擴增到幾乎線粒體全長,并進行高深度測序,下游提供常規(guī)比對篩查突變等生物信息分析??蛻籼峁悠奉愋停?.人來源DNA,濃度大于1ng/ul,總量大于20ng,以Qubit檢測結(jié)果為準2.運輸條件:冰袋運輸。交付信息:1.測序原始數(shù)據(jù)交付實驗報告2.測序原始數(shù)據(jù)3.突變分析結(jié)果。X儀器本身有16個通道(Controller為8通道),每個通道極限多捕獲20000個細胞(Controller為10000個細胞) 。上...
懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運作的呢?單細胞懸液質(zhì)控要求:?細胞濃度:700-1200cells/μl;?細胞活率>80%(當細胞懸液活率低于70%時建議進行去除死細胞處理);細胞團及碎片雜質(zhì)<5%(無細胞粘連,無明顯的細胞碎片和細胞團,并保證細胞的完整性);?細胞狀態(tài):細胞直徑在7-40um之間(細胞直徑過大則建議進行抽核處理);?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細胞的核酸分子。單細胞測序技術(shù)可以檢測復雜組織中單個細胞不同的生物學特性.上?;蚪M高通量測序通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果:明場(細胞未染色):主要可以觀察懸液背景質(zhì)量(背景干...
擴增子測序,項目介紹:隨著基因編輯技術(shù)(尤其是CRISPR-cas9技術(shù))的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測序技術(shù)無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過對靶基因區(qū)域附近設(shè)計引物,進行PCR擴增,并對PCR產(chǎn)物進行高通量測序,可以快速高效的獲得目標區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠遠優(yōu)于一代測序,性價比極高。16S全長分類測序,項目介紹:16S全長測序分析主要是對 16S rRNA基因全長進行擴增,基于PacBio 測序平臺測序. 相比較二代測序只選擇 1-2 個高變區(qū)進行測序,三代可以獲得全長的 16S 序列,更多變異區(qū)信息可以提高物種鑒定的分辨率,還可以提高對于群落組成...
什么是KBSeq全質(zhì)粒測序?它基于第二代測序技術(shù),一次性對大量質(zhì)粒(比較多可達6000個樣本)進行并行測序,利用生物信息學分析,對數(shù)據(jù)進行序列組裝并獲得每一個質(zhì)粒的完整序列信息。所以我們也稱它為,可以部分替代一代測序的高通量測序技術(shù)。測序長度:對于測序長度較長,如果我們用Sanger測序往往需要花費大量的時間,而我們KBSeq全質(zhì)粒測序則只需要5-7天,就可以測通片段長度小于30kb以下的片段。樣本用量:KBSeq全質(zhì)粒測序?qū)τ跇颖镜牧?,要求的也比較少,比如質(zhì)粒我們的樣本要求DNA的濃度需≥ 1 ng/μl, 體積需≥5 μl,如果比較珍貴的樣本或者是樣本比較難提取的,KBSeq就更為適合了。...
2021年11月1日,在這個平凡而又特殊的日子里,生工生物高通量測序部迎來了一位新成員——10xGenomics Chromium X!不要看我們個頭小,我們可是百萬級單細胞捕獲神器吆。X是如何實現(xiàn)單次運行有這么高的吞吐量呢?多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個通道(Controller為8通道),每個通道比較多捕獲20000個細胞(Controller為10000個細胞)。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù),每個通道比較多可捕獲60,000個細胞,去除雙細胞率后,每張芯片比較多可捕獲750,000個單細胞。生工生物接受客戶自備文庫測序項目。上海...
細胞質(zhì)檢時染料染色的原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一種小分子染料,可以通過完整的細胞膜,嵌入所有細胞(活細胞和死細胞)的細胞核,呈現(xiàn)綠色熒光;碘化丙啶(PI)只能通過不完整的細胞膜,即死細胞的細胞膜,嵌入所有死細胞的細胞核,呈現(xiàn)紅色熒光,通過標記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細胞和死細胞,這種特異性染色的方法也可以排除無核細胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。如果你的樣品是質(zhì)?;蛘呤蔷?,那為什么不試試我們的KBSeq呢?微生物高通量測序平臺使用顯微鏡...
對于用RNA組織保存液寄送的樣品,請按照RNA組織保存液說明保存和寄送。請注意:1)樣品浸入組織保存液之前,對于動物組織樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.5cm的碎塊;對于植物樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.3cm的碎塊。2)鼠肝、腎和脾等小organ樣品和沒有蠟質(zhì)保護層的植物樣品可不剪切直接放入保存液中保存,有蠟質(zhì)保護層的植物樣品需要先將蠟表皮破壞。3)確保將樣品完全浸泡在保存液中,不讓其粘貼在管壁和蓋上。生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例。上海lncRNA高通量測序公司生工CHIP-Seq,項目介紹:CHIP-SEQ 技術(shù),即染色質(zhì)免疫共沉...
怎樣通過血球計數(shù)板進行質(zhì)檢操作呢?將血球計數(shù)板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計數(shù)板上;將細胞懸液混勻(或10μl臺盼藍+10μl細胞懸液),吸出10μl懸液至計數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細胞核懸液鋪滿蓋玻片和計數(shù)板之間;在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個計數(shù)區(qū)域進行計數(shù);按細胞計數(shù)公式進行計算,計算公式:細胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數(shù),V1/V2/V3/V4為各個計數(shù)區(qū)的細胞數(shù)目,細胞活率=活細胞數(shù)目/總細胞數(shù)目*100%。寄送 RNA 樣品請置于 1.5 ml 離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用 Parafilm 封口。上海地...
生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。生物信息分析經(jīng)驗豐富,可以滿足客戶標準分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標準化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準),全部free。生工生物擁有生命科學領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目,一站式解決問題。同時生工生物單細胞團隊目前已同時擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺,可為您提供超高通量和低通量單細胞樣本雙重。KBSeq全質(zhì)粒測序?qū)τ跇颖?..
生工外顯子測序,項目介紹:已知人類基因組上有180000個外顯子,占整個基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負責編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測 序,全外顯子捕獲測序有測序深度高、價格便宜的優(yōu)勢,性價比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告。RNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子。上海地區(qū)宏全基因...
small RNA測序,項目簡介:Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而調(diào)節(jié)細胞生長、分化,以及個體發(fā)育、生殖等重要生物學過程。高通量測序技術(shù)可以對樣本中所有small RNA家族進行測序和表達定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應靶序列。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后,進行Clean reads 長度分布統(tǒng)計,small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 mi...
使用顯微鏡進行懸液質(zhì)檢操作時應注意:1.使用血球計數(shù)板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層,則需要多次清洗,直至計數(shù)室潔凈無瑕;2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口gun頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數(shù),一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數(shù)目過多,難以數(shù)清,應當對細胞懸液進行稀釋以便于計數(shù);5.對于壓在方格界線上的細胞應當計數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細胞數(shù),一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線,數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理,另兩邊不計數(shù)。請注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。上海市生工生物 高通量測序應用KBSeq全質(zhì)粒測序跟一代測序相比有什么優(yōu)...
生工其他PCR產(chǎn)物測序,項目介紹:隨著基因編輯技術(shù)(尤其是CRISPR-cas9技術(shù))的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測序無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過對靶基因區(qū)域附近設(shè)計引物,進行PCR擴增,并對PCR產(chǎn)物進行高通量測序,可以快速高效的獲得目標區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠遠優(yōu)于一代測序,性價比極高??侱NA 或者包裝完好的原始樣品(如土壤、糞便、 水體和口腔物);樣品名稱清晰,冷藏運輸。如有對照與實驗樣品的區(qū)分,標明正常樣品與實驗樣品,如有分組,詳細描述分組分析信息,以及分組比較的分析需求信息。寄送 RNA 樣品請置于 1.5 ml 離心管中,管上注明樣品...
生工CHIP-Seq,項目介紹:CHIP-SEQ 技術(shù),即染色質(zhì)免疫共沉淀與高通量測序相結(jié)合的技術(shù)。它是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA 相互作用的有力工具,還可以用來研究轉(zhuǎn)錄因子與基因表達的關(guān)系。通過高通量測序,可以一次性得到目的蛋白在整個基因組上的結(jié)合分布,得到目的蛋白精確的結(jié)合位點以及結(jié)合基序等信息。ChIP-Seq 的原理:首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA 的所屬片段,并對其進行純化與文庫構(gòu)建;然后對富集得到的DNA的片段進行高通量測序,將獲得的數(shù)百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。高通量測序...
生工外顯子測序,項目介紹:已知人類基因組上有180000個外顯子,占整個基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負責編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測 序,全外顯子捕獲測序有測序深度高、價格便宜的優(yōu)勢,性價比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告。在運輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中,再將50 ml管放在封口袋中。上海地區(qū)lncRNA高通量測序微生物基因組重...
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序,其研究主要包括3個方面:第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測序,是對未知基因組序列的物種進行基因組測序,并綜合利用不同測序技術(shù)和生物信息學工具對研究物種進行序列拼接和修正,進而獲得該物種的基因組序列圖譜;第二種為常見的全基因組重測序,是對已知基因組序列的物種進行個體或群體的測序研究,建立一個測序文庫進行單個個體或不同個體混合池測序,發(fā)現(xiàn)遺傳變異標記,進行后續(xù)的研究;第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上,對不同品種的具有代表性個體建立多個文庫進行全基因組從頭組裝測序,此方法能夠進一步的進行參考基因組的修補和發(fā)現(xiàn)短序列比對難以發(fā)現(xiàn)的遺傳...
16s/18s/ITS微生物分類測序,項目介紹:環(huán)境微生物是自然界中分布建議廣、種類建議多、數(shù)量比較大的生物類群,其群落結(jié)構(gòu)及多樣性和微生物的功能及代謝機理是微生物生態(tài)學的研究熱點,對于我們研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、環(huán)境治理和微生物資源的利用以及人類醫(yī)療健康有著重要的理論和現(xiàn)實意義。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展以及大量序列數(shù)據(jù)的積累,通用引物擴增結(jié)合高通量測序技術(shù),可以快速檢索環(huán)境內(nèi)微生物的群落結(jié)構(gòu)。這項運用我們稱之為微生物分類測序。如Illumina公司的MiSeq高通量測序平臺不僅可實現(xiàn)對多樣品的多個可變區(qū)同時測序,而且在測序速度和測序通量上都有進一步提升,目前此平臺已在微生物多樣性群落結(jié)構(gòu)研究...
為什么要用單細胞測序技術(shù)?細胞是生物體結(jié)構(gòu)和功能的基本單位,在生物體生長發(fā)育的過程中,因細胞類型、外界環(huán)境以及內(nèi)部調(diào)節(jié)因素的不同,其轉(zhuǎn)錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程,以及在細胞分裂和分化過程中出現(xiàn)的誤差造成來自同一細胞系或個體的細胞呈現(xiàn)出不同的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細胞異質(zhì)性。細胞異質(zhì)性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測序檢測的是一個細胞群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組的信息,如培養(yǎng)的大量細胞、動植物組織甚至是整個生物體。在過去的20多年中,人們對轉(zhuǎn)錄組的人數(shù)仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),...
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序中,制備高質(zhì)量的單細胞懸液至關(guān)重要。而懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運作的呢?單細胞懸液質(zhì)控要求:?細胞濃度:700-1200cells/μl;?細胞活率>80%(當細胞懸液活率低于70%時建議進行去除死細胞處理);細胞團及碎片雜質(zhì)<5%(無細胞粘連,無明顯的細胞碎片和細胞團,并保證細胞的完整性);?細胞狀態(tài):細胞直徑在7-40um之間(細胞直徑過大則建議進行抽核處理);?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細胞的核酸分子。DNA樣品請?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運輸,不超過...
臺盼藍染色原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。 通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果:明場(細胞未染色):主要可以觀察懸液背景質(zhì)量(背景干凈,無雜質(zhì)碎片,無細胞團塊);臺盼藍場(細胞與臺盼藍染色后):主要可以觀察活性(主要為活細胞,未染色藍色的為活細胞);通過臺盼藍場計算活率:90%>80%;細胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來看,血球計數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標均符合上機標準,屬于高質(zhì)量單細胞懸液。 對于需要進行RNA抽提的部分特殊樣品,可以將組織在液氮中研...
RNA類高通量測序樣品要求:對于需要進行 RNA 抽提的樣品,請使用新鮮取樣的實驗材料,當場分成小塊(動物樣品厚度需小于0.5 cm,植物樣品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗,在秋冬季節(jié),如果打包合適,5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時,而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些)中用保溫箱寄送。一般組織樣品,送樣量至少200 mg/樣;如果樣品屬于孢子,送樣量至少500 mg/樣。高通量測序技術(shù)是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。上海地區(qū)基因組高通量測序產(chǎn)品生工高通量測序樣品要求,RNA樣品:請?zhí)峁舛取?..
生工人、大、小鼠全基因組測序,項目介紹:人或者大、小鼠全部基因組重測序,研究其突變信息(包括SNP/InDel/CNV/SV),并注釋突變位點信息。該技術(shù)可同時獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息,被廣泛應用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測序平臺:HiSeq XTen平臺進行PE150測序。生工微生物基因組測序,項目介紹:微生物基因組重測序(有參)目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進行進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術(shù),對有參考基因組微生物進行多個體的基因組重測序,精細分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異...
16s/18s/ITS微生物分類測序,項目介紹:環(huán)境微生物是自然界中分布建議廣、種類建議多、數(shù)量比較大的生物類群,其群落結(jié)構(gòu)及多樣性和微生物的功能及代謝機理是微生物生態(tài)學的研究熱點,對于我們研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、環(huán)境治理和微生物資源的利用以及人類醫(yī)療健康有著重要的理論和現(xiàn)實意義。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展以及大量序列數(shù)據(jù)的積累,通用引物擴增結(jié)合高通量測序技術(shù),可以快速檢索環(huán)境內(nèi)微生物的群落結(jié)構(gòu)。這項運用我們稱之為微生物分類測序。如Illumina公司的MiSeq高通量測序平臺不僅可實現(xiàn)對多樣品的多個可變區(qū)同時測序,而且在測序速度和測序通量上都有進一步提升,目前此平臺已在微生物多樣性群落結(jié)構(gòu)研究...
懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運作的呢?單細胞懸液質(zhì)控要求:?細胞濃度:700-1200cells/μl;?細胞活率>80%(當細胞懸液活率低于70%時建議進行去除死細胞處理);細胞團及碎片雜質(zhì)<5%(無細胞粘連,無明顯的細胞碎片和細胞團,并保證細胞的完整性);?細胞狀態(tài):細胞直徑在7-40um之間(細胞直徑過大則建議進行抽核處理);?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細胞的核酸分子。請注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。上海地區(qū)lncRNA高通量測序技術(shù)怎樣通過血球計數(shù)板進行質(zhì)檢操作呢?將血球計數(shù)板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計數(shù)板上...
擴增子測序,項目介紹:隨著基因編輯技術(shù)(尤其是CRISPR-cas9技術(shù))的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測序技術(shù)無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過對靶基因區(qū)域附近設(shè)計引物,進行PCR擴增,并對PCR產(chǎn)物進行高通量測序,可以快速高效的獲得目標區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠遠優(yōu)于一代測序,性價比極高。16S全長分類測序,項目介紹:16S全長測序分析主要是對 16S rRNA基因全長進行擴增,基于PacBio 測序平臺測序. 相比較二代測序只選擇 1-2 個高變區(qū)進行測序,三代可以獲得全長的 16S 序列,更多變異區(qū)信息可以提高物種鑒定的分辨率,還可以提高對于群落組成...