生工優(yōu)勢(shì)：1.生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn)，日均處理樣品200余例，涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動(dòng)物組織/細(xì)胞等樣品，省去您處理樣品的繁瑣過(guò)程。2.生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富，可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容（以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)），全部無(wú)費(fèi)用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系，可以承接從分子到蛋白各個(gè)層級(jí)的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目。一站式解決問題。近年來(lái)，隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和普及，單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)發(fā)展十分迅速。上海市small RNA高通量測(cè)序服務(wù)生工人、大、小鼠全基因組測(cè)序，項(xiàng)目介紹：人或者大、小鼠全部基因組重...

細(xì)胞質(zhì)檢時(shí)染料染色的原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一種小分子染料，可以通過(guò)完整的細(xì)胞膜，嵌入所有細(xì)胞（活細(xì)胞和死細(xì)胞）的細(xì)胞核，呈現(xiàn)綠色熒光；碘化丙啶（PI）只能通過(guò)不完整的細(xì)胞膜，即死細(xì)胞的細(xì)胞膜，嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核，呈現(xiàn)紅色熒光，通過(guò)標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞，這種特異性染色的方法也可以排除無(wú)核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。請(qǐng)注意選擇無(wú)RNA酶的容器盛放樣本，盡量避免RNA降解。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)于細(xì)胞樣...

對(duì)于微生物樣品，請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種；對(duì)于可能致病的微生物，生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品，需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來(lái)，用干冰寄送；以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品，需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品，用RNA組織保存液（例如RNA-Be-Locker A）保存，以干冰或冰袋寄送；沒有RNA組織保存液的情況下，也可用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C 冰箱，埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達(dá)到100 mg/樣；細(xì)菌樣品送樣量需至少達(dá)到107（10的7次方）數(shù)量級(jí)，同時(shí)，在與樣本一同寄送的送樣表上，標(biāo)明屬于革蘭氏陽(yáng)性菌（G+）還是革蘭氏陰性菌（G-）。單細(xì)胞測(cè)序到底是什么？上海small RNA高通...

IlluminaHiSeq2500/4000可以運(yùn)行PE150/PE250模式，可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、人基因組重測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、宏基因組測(cè)序、微生物分類測(cè)序等服務(wù)；IlluminaMiSeq運(yùn)行PE300模式，可以承擔(dān)細(xì)菌基因組重測(cè)序/Denovo測(cè)序、微生物分類測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序、核酸適配體測(cè)序等服務(wù)；LifeIontorrentPGM運(yùn)行314、316、318芯片，可以承接擴(kuò)增子測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序、基因組重測(cè)序服務(wù)；PacBioSequel/RSII該測(cè)序平臺(tái)讀長(zhǎng)超長(zhǎng)，平均可達(dá)10kb以上，主要承接細(xì)菌基因組完成圖測(cè)序、***基因組精細(xì)圖測(cè)序、全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本測(cè)序等服務(wù)；生工生物已開展10x單細(xì)...

土壤樣本請(qǐng)置于2 mL離心管里（多準(zhǔn)備幾管備用），為保護(hù)樣本管，樣本管置于保護(hù)用的50 mL離心管或其他類似容器里，并旋緊蓋子；如常溫采的樣品，可以采用藍(lán)冰運(yùn)輸；如果是高溫發(fā)酵罐或者樣品已經(jīng)凍存-80°C，需要用足量干冰運(yùn)輸； DNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里，并旋緊蓋子；藍(lán)冰運(yùn)輸；RNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里，并旋緊蓋子；用足量干冰運(yùn)輸。 生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容（以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)），全部無(wú)費(fèi)用。ITS高通量測(cè)序服務(wù)生工靶向捕獲測(cè)序，項(xiàng)目介...

RNA類高通量測(cè)序樣品要求：對(duì)于需要進(jìn)行 RNA 抽提的樣品，請(qǐng)使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料，當(dāng)場(chǎng)分成小塊（動(dòng)物樣品厚度需小于0.5 cm，植物樣品厚度需小于0.3 cm）后立即用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C 冰箱，埋于足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗(yàn)，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時(shí)，而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些）中用保溫箱寄送。一般組織樣品，送樣量至少200 mg/樣；如果樣品屬于孢子，送樣量至少500 mg/樣。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序?qū)τ跇颖镜牧?，要求的也比較少。上海SNP高通量測(cè)序測(cè)序生工CHIP-Seq，項(xiàng)目介紹：CHIP-SEQ 技術(shù)，即染色...

單細(xì)胞測(cè)序是什么？單細(xì)胞測(cè)序是基于高通量測(cè)序（Next-generationsequencingtechnology，NGS）方法，檢測(cè)群體中單細(xì)胞基因組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞表觀基因組及單細(xì)胞蛋白組，提供細(xì)胞間差異的高分辨率視圖，從分子水平揭示細(xì)胞奧秘。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（Single-cellRNA-Sequencing，ScRNA-Seq）指在單細(xì)胞水平上對(duì)mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù)。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序能獲得單個(gè)細(xì)胞內(nèi)近萬(wàn)個(gè)基因的表達(dá)信息，為辨別生物組織中各種細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組特征和全方面揭示細(xì)胞之間基因表達(dá)的異質(zhì)性提供了有力的工具[3]。說(shuō)到細(xì)胞異質(zhì)性（Cellheterogenei...

2021年11月1日，在這個(gè)平凡而又特殊的日子里，生工生物高通量測(cè)序部迎來(lái)了一位新成員——10xGenomics Chromium X！不要看我們個(gè)頭小，我們可是百萬(wàn)級(jí)單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢？多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道（Controller為8通道），每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞（Controller為10000個(gè)細(xì)胞）。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)，每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞，去除雙細(xì)胞率后，每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序只能測(cè)菌液和質(zhì)粒，...

通過(guò)顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢能觀察到懸液背景質(zhì)量和細(xì)胞數(shù)目及活性的評(píng)估。讓我們?cè)賮?lái)回顧一下臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。怎樣通過(guò)血球計(jì)數(shù)板進(jìn)行質(zhì)檢操作呢？將血球計(jì)數(shù)板擦拭干凈，取干凈的蓋玻片蓋在計(jì)數(shù)板上；將細(xì)胞懸液混勻（或10μl臺(tái)盼藍(lán)+10μl細(xì)胞懸液），吸出10μl懸液至計(jì)數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細(xì)胞核懸液鋪滿蓋玻片和計(jì)數(shù)板之間；在顯微鏡下分別對(duì)V1/V2/V3/V4四個(gè)計(jì)數(shù)區(qū)域進(jìn)行計(jì)數(shù)；按細(xì)胞計(jì)數(shù)公式進(jìn)行計(jì)算，計(jì)算公式：細(xì)胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10...

生工高通量測(cè)序樣品要求，RNA樣品：請(qǐng)?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品，樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)行DNase處理;請(qǐng)務(wù)必提供每個(gè)樣品具體的濃度、體積、制備時(shí)間以及物種來(lái)源。比較好附上QC數(shù)據(jù)，可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)等;一般情況下，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測(cè)獲得的總RNA 28S:18S≥1，RIN≥7;小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒，可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法（如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等）或者選用專門的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請(qǐng)置于1...

真核/原核無(wú)參mRNA-Seq，項(xiàng)目介紹；測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái)，測(cè)序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進(jìn)行拼接，并進(jìn)一步對(duì)拼接所得轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋、CDD、CDS分析，SNP分析，SSR標(biāo)記開發(fā)等分析。在計(jì)算基因的表達(dá)量后，進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對(duì)于多個(gè)樣本，可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外，還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析，深入研究基因功能，進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息，為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。 特別申明：不能采用過(guò)柱離心的方法提取總RNA。上海地區(qū)生工高通...

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，項(xiàng)目介紹：RNA-Seq，是基于新一代測(cè)序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法：首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進(jìn)行 mRNA 富集，然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進(jìn)行新一代高通量測(cè)序，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行短片段拼接組裝，從而獲得一個(gè)個(gè)單獨(dú)轉(zhuǎn)錄本，進(jìn)而可以對(duì)該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達(dá)狀況有全局了解。對(duì)不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行 比較分析，則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化，針對(duì)關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路（Pathway）的構(gòu)建。小RNA測(cè)測(cè)序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。上海多重PCR高通量測(cè)序公司small RNA測(cè)序，項(xiàng)目簡(jiǎn)介：Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子，長(zhǎng)...

生工優(yōu)勢(shì)：1.生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn)，日均處理樣品200余例，涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動(dòng)物組織/細(xì)胞等樣品，省去您處理樣品的繁瑣過(guò)程。2.生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富，可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容（以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)），全部無(wú)費(fèi)用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系，可以承接從分子到蛋白各個(gè)層級(jí)的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目。一站式解決問題。請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖，濃度>20 ng/μl，總量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA，可冰袋運(yùn)輸，不超過(guò)3天。上海地區(qū)微生物高通量測(cè)序產(chǎn)品單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中，制備高質(zhì)量...

使用顯微鏡進(jìn)行懸液質(zhì)檢操作時(shí)應(yīng)注意：1.使用血球計(jì)數(shù)板時(shí)，可以提前鏡檢觀察每小格計(jì)數(shù)室內(nèi)是否潔凈無(wú)雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層，則需要多次清洗，直至計(jì)數(shù)室潔凈無(wú)瑕；2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴(kuò)口***頭吹打混勻；3.臺(tái)盼藍(lán)染色后需要盡快完成細(xì)胞計(jì)數(shù)，一般建議不要超過(guò)10分鐘；4.如果方格中細(xì)胞數(shù)目過(guò)多，難以數(shù)清，應(yīng)當(dāng)對(duì)細(xì)胞懸液進(jìn)行稀釋以便于計(jì)數(shù)；5.對(duì)于壓在方格界線上的細(xì)胞應(yīng)當(dāng)計(jì)數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細(xì)胞數(shù)，一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線，數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理，另兩邊不計(jì)數(shù)。ChIP項(xiàng)目至少要求50ng DNA，以Qubit 2.0檢測(cè)為準(zhǔn)。其余具體咨詢生工高通量測(cè)序部。ITS高通量測(cè)序高通量如果你的...

KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序跟一代測(cè)序相比有什么優(yōu)點(diǎn)呢？一代測(cè)序：1.數(shù)據(jù)質(zhì)量，套峰，雙峰等情況，需要人工分析校對(duì)。2.測(cè)序長(zhǎng)度，1 kb。3.成本，低。4.樣本用量，100 ng。5.精確度，70-90%。6.測(cè)序能力，需要測(cè)序引物，只能測(cè)測(cè)序引物間的片段序列。7.通量低，（與讀長(zhǎng)有關(guān)）。8.實(shí)驗(yàn)周期，如果片段長(zhǎng)度超過(guò)5K，測(cè)通可能需要15天左右。對(duì)于測(cè)序長(zhǎng)度較長(zhǎng)，如果我們用Sanger測(cè)序往往需要花費(fèi)大量的時(shí)間，而我們KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序則只需要5-7天，就可以測(cè)通片段長(zhǎng)度小于30kb以下的片段。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序?qū)τ跇颖镜牧浚蟮囊脖容^少，比如質(zhì)粒我們的樣本要求DNA的濃度需≥ 1 ng/μ...

使用顯微鏡進(jìn)行懸液質(zhì)檢操作時(shí)應(yīng)注意：1.使用血球計(jì)數(shù)板時(shí)，可以提前鏡檢觀察每小格計(jì)數(shù)室內(nèi)是否潔凈無(wú)雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層，則需要多次清洗，直至計(jì)數(shù)室潔凈無(wú)瑕；2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴(kuò)口***頭吹打混勻；3.臺(tái)盼藍(lán)染色后需要盡快完成細(xì)胞計(jì)數(shù)，一般建議不要超過(guò)10分鐘；4.如果方格中細(xì)胞數(shù)目過(guò)多，難以數(shù)清，應(yīng)當(dāng)對(duì)細(xì)胞懸液進(jìn)行稀釋以便于計(jì)數(shù)；5.對(duì)于壓在方格界線上的細(xì)胞應(yīng)當(dāng)計(jì)數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細(xì)胞數(shù)，一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線，數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理，另兩邊不計(jì)數(shù)。10xGenomics Chromium X多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。上海市16s高通量測(cè)序應(yīng)用s...

對(duì)于用RNA組織保存液寄送的樣品，請(qǐng)按照RNA組織保存液說(shuō)明保存和寄送。請(qǐng)注意：1)樣品浸入組織保存液之前，對(duì)于動(dòng)物組織樣品，須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.5cm的碎塊；對(duì)于植物樣品，須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.3cm的碎塊。2)鼠肝、腎和脾等小organ樣品和沒有蠟質(zhì)保護(hù)層的植物樣品可不剪切直接放入保存液中保存，有蠟質(zhì)保護(hù)層的植物樣品需要先將蠟表皮破壞。3)確保將樣品完全浸泡在保存液中，不讓其粘貼在管壁和蓋上。高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。上海羥甲基化測(cè)序高通量測(cè)序項(xiàng)目樣本寄送時(shí)，請(qǐng)將填寫完整的紙質(zhì)版《高通量測(cè)序送樣表》密封于塑料袋內(nèi)，隨樣本一...

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序技術(shù)可以檢測(cè)復(fù)雜組織中單個(gè)細(xì)胞不同的生物學(xué)特性，這可以極大的幫助我們進(jìn)一步了解細(xì)胞與細(xì)胞之間的差異。"這幾乎就像通過(guò)幾顆星星看到了整個(gè)宇宙。"哈佛大學(xué)分子和細(xì)胞生物學(xué)教授 Alexander Schier的這句話應(yīng)用在這里也是很合適了。這幅圖正是來(lái)自于在2018年4月 Science 雜志發(fā)表的三篇[8-10]來(lái)自哈佛醫(yī)學(xué)院和哈佛大學(xué)的研究人員關(guān)于單細(xì)胞基因測(cè)序文章中的一幅結(jié)果圖，Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。這幾篇文章使用多種檢測(cè)技術(shù)組合，其中包括對(duì)數(shù)千個(gè)發(fā)育中的斑馬魚和青蛙胚胎單細(xì)胞測(cè)序，在胚胎發(fā)育建議初的24小時(shí)內(nèi)追蹤單個(gè)細(xì)胞...

使用顯微鏡進(jìn)行懸液質(zhì)檢操作時(shí)應(yīng)注意：1.使用血球計(jì)數(shù)板時(shí)，可以提前鏡檢觀察每小格計(jì)數(shù)室內(nèi)是否潔凈無(wú)雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層，則需要多次清洗，直至計(jì)數(shù)室潔凈無(wú)瑕；2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴(kuò)口***頭吹打混勻；3.臺(tái)盼藍(lán)染色后需要盡快完成細(xì)胞計(jì)數(shù)，一般建議不要超過(guò)10分鐘；4.如果方格中細(xì)胞數(shù)目過(guò)多，難以數(shù)清，應(yīng)當(dāng)對(duì)細(xì)胞懸液進(jìn)行稀釋以便于計(jì)數(shù)；5.對(duì)于壓在方格界線上的細(xì)胞應(yīng)當(dāng)計(jì)數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細(xì)胞數(shù)，一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線，數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理，另兩邊不計(jì)數(shù)。近年來(lái)，隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和普及，單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)發(fā)展十分迅速。上海宏全基因組高通量測(cè)序NGS 土壤樣本請(qǐng)置于2 mL離心...

擴(kuò)增子測(cè)序，項(xiàng)目介紹：隨著基因編輯技術(shù)（尤其是CRISPR-cas9技術(shù)）的發(fā)展，科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測(cè)序技術(shù)無(wú)法快速有效鑒定基因編輯效率。但是，通過(guò)對(duì)靶基因區(qū)域附近設(shè)計(jì)引物，進(jìn)行PCR擴(kuò)增，并對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序，可以快速高效的獲得目標(biāo)區(qū)域的突變頻率信息，尤其是對(duì)低頻突變的檢測(cè)效果遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于一代測(cè)序，性價(jià)比極高。16S全長(zhǎng)分類測(cè)序，項(xiàng)目介紹：16S全長(zhǎng)測(cè)序分析主要是對(duì) 16S rRNA基因全長(zhǎng)進(jìn)行擴(kuò)增，基于PacBio 測(cè)序平臺(tái)測(cè)序. 相比較二代測(cè)序只選擇 1-2 個(gè)高變區(qū)進(jìn)行測(cè)序，三代可以獲得全長(zhǎng)的 16S 序列，更多變異區(qū)信息可以提高物種鑒定的分辨率，還可以提高對(duì)于群落組成...

真核/原核無(wú)參mRNA-Seq，項(xiàng)目介紹；測(cè)序使用Illumina Xten平臺(tái)，測(cè)序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進(jìn)行拼接，并進(jìn)一步對(duì)拼接所得轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋、CDD、CDS分析，SNP分析，SSR標(biāo)記開發(fā)等分析。在計(jì)算基因的表達(dá)量后，進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對(duì)于多個(gè)樣本，可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外，還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析，深入研究基因功能，進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息，為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。 關(guān)鍵是KBSeq還可以省錢。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序長(zhǎng)鏈非編碼...

細(xì)胞質(zhì)檢時(shí)染料染色的原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一種小分子染料，可以通過(guò)完整的細(xì)胞膜，嵌入所有細(xì)胞（活細(xì)胞和死細(xì)胞）的細(xì)胞核，呈現(xiàn)綠色熒光；碘化丙啶（PI）只能通過(guò)不完整的細(xì)胞膜，即死細(xì)胞的細(xì)胞膜，嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核，呈現(xiàn)紅色熒光，通過(guò)標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞，這種特異性染色的方法也可以排除無(wú)核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。請(qǐng)寄送樣本（尤其是細(xì)胞樣本）之前鑒定樣本所屬物種。上海地區(qū)宏全基因組高通量測(cè)序?qū)τ诩?xì)胞樣品，送...

簡(jiǎn)化基因組測(cè)序，項(xiàng)目介紹：通過(guò)限制性內(nèi)切酶對(duì)基因組DNA進(jìn)行酶切，并對(duì)酶切片段進(jìn)行高通量測(cè)序，這種通過(guò)酶切降低基因組的復(fù)雜度的測(cè)序技術(shù)統(tǒng)稱為簡(jiǎn)化基因 組測(cè)序技術(shù)。利用生物信息學(xué)方法，進(jìn)行SNP單體型圖譜繪制，全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS），連鎖分析和QTL定位分析，種群進(jìn)化，主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測(cè)序，項(xiàng)目介紹：宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA，隨后進(jìn)行大規(guī)模高通量測(cè)序（shotgun 策 略）。測(cè)到數(shù)據(jù)后，先進(jìn)行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控，而后進(jìn)行基因組拼接、注釋（物種、基因功能），使得我們可以獲取環(huán)境樣品...

懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細(xì)胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運(yùn)作的呢？單細(xì)胞懸液質(zhì)控要求：?細(xì)胞濃度：700-1200cells/μl；?細(xì)胞活率>80%（當(dāng)細(xì)胞懸液活率低于70%時(shí)建議進(jìn)行去除死細(xì)胞處理）；細(xì)胞團(tuán)及碎片雜質(zhì)<5%（無(wú)細(xì)胞粘連，無(wú)明顯的細(xì)胞碎片和細(xì)胞團(tuán)，并保證細(xì)胞的完整性）；?細(xì)胞狀態(tài)：細(xì)胞直徑在7-40um之間（細(xì)胞直徑過(guò)大則建議進(jìn)行抽核處理）；?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細(xì)胞的核酸分子。KBSeq全質(zhì)粒測(cè)序只能測(cè)菌液和質(zhì)粒，像PCR產(chǎn)物什么的還是送一代測(cè)序吧。ITS高通量測(cè)序平臺(tái)small RNA測(cè)序，項(xiàng)目簡(jiǎn)介：Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子，...

土壤樣本請(qǐng)置于2 mL離心管里（多準(zhǔn)備幾管備用），為保護(hù)樣本管，樣本管置于保護(hù)用的50 mL離心管或其他類似容器里，并旋緊蓋子；如常溫采的樣品，可以采用藍(lán)冰運(yùn)輸；如果是高溫發(fā)酵罐或者樣品已經(jīng)凍存-80°C，需要用足量干冰運(yùn)輸； DNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里，并旋緊蓋子；藍(lán)冰運(yùn)輸；RNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好，并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里，并旋緊蓋子；用足量干冰運(yùn)輸。 寄送 RNA 樣品請(qǐng)置于 1.5 ml 離心管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時(shí)間，管口使用 Parafilm 封口。上海...

單細(xì)胞懸液質(zhì)檢方法，在進(jìn)行單細(xì)胞懸液質(zhì)檢時(shí)，需要用到以下兩大質(zhì)檢利器的輔助：熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀（主要使用臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色法）進(jìn)行質(zhì)檢。首先我們先要了解一下細(xì)胞質(zhì)檢時(shí)染料染色的原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測(cè)結(jié)果可以讓我們直觀的看到：細(xì)胞濃度（總細(xì)胞，活細(xì)胞，死細(xì)胞）、細(xì)胞存活率（臺(tái)盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色）、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。對(duì)于需要進(jìn)行RNA抽提的部分特殊樣品，可以將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送。...

臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。 通過(guò)顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果：明場(chǎng)（細(xì)胞未染色）：主要可以觀察懸液背景質(zhì)量（背景干凈，無(wú)雜質(zhì)碎片，無(wú)細(xì)胞團(tuán)塊）；臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)（細(xì)胞與臺(tái)盼藍(lán)染色后）：主要可以觀察活性（主要為活細(xì)胞，未染色藍(lán)色的為活細(xì)胞）；通過(guò)臺(tái)盼藍(lán)場(chǎng)計(jì)算活率：90%>80%；細(xì)胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來(lái)看，血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標(biāo)均符合上機(jī)標(biāo)準(zhǔn)，屬于高質(zhì)量單細(xì)胞懸液。 使用足量的干冰運(yùn)輸，并且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運(yùn)輸...

全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（Total RNA-Seq），項(xiàng)目介紹：全轉(zhuǎn)錄組是指特定細(xì)胞在特定狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA（non-coding RNA）。針對(duì)非編碼RNA的研究主要集中在具有調(diào)控作用的miRNA，lncRNA和circRNA。基于二代測(cè)序技術(shù)的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究，同時(shí)分析同一樣本中的mRNA，lncRNA，circRNA和miRNA，并且通過(guò)關(guān)聯(lián)分析，使研究?jī)?nèi)容更加系統(tǒng)化，致力于深入挖掘生命現(xiàn)象背后的轉(zhuǎn)錄調(diào)控問題。組織樣品或者總 RNA， 樣品名稱清晰，干冰運(yùn)輸。寄送RNA樣品請(qǐng)置于1.5 ml離心管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時(shí)間，管口使用Para...

生工外顯子測(cè)序，項(xiàng)目介紹：已知人類基因組上有180000個(gè)外顯子，占整個(gè)基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負(fù)責(zé)編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復(fù)雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測(cè) 序，全外顯子捕獲測(cè)序有測(cè)序深度高、價(jià)格便宜的優(yōu)勢(shì)，性價(jià)比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng)，可以高效富集人全外顯子區(qū)域，并結(jié)合Illumina XTen測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行深度測(cè)序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測(cè)，形成完整的分析報(bào)告。特別申明：不能采用過(guò)柱離心的方法提取總RNA。上海市靶向捕獲高通量測(cè)序高通量懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備...

核酸適配體測(cè)序，項(xiàng)目介紹：核酸適配體是一類能夠特異性地和靶物質(zhì)結(jié)合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白質(zhì)、金屬離子、小分子化合物、細(xì)胞膜表面受體等靶標(biāo)。其結(jié)合能力可與抗體相當(dāng)甚至更強(qiáng)，同時(shí)具有低免疫原性、 穩(wěn)定性好等特點(diǎn)，并可結(jié)合各種藥物及載體構(gòu)建多元復(fù)合靶向給藥系統(tǒng)用于tumour靶向treat, 在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有潛在高價(jià)值。生工生物針對(duì)核酸適配體特殊結(jié)構(gòu)，結(jié)合Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái)，可以快速對(duì)核酸適配體文庫(kù)進(jìn)行大規(guī)模高通量測(cè)序，省去克隆測(cè)序的麻煩，提高測(cè)序深度，快速計(jì)算適配體序列頻率，方便科研客戶快速評(píng)估序列富集程度。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)可以檢測(cè)復(fù)雜組織中單個(gè)細(xì)胞不同的生物學(xué)特性.單細(xì)胞...