Tag標(biāo)簽
  • 上海市small RNA高通量測序服務(wù)
    上海市small RNA高通量測序服務(wù)

    生工優(yōu)勢:1.生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。2.生物信息分析經(jīng)驗豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準(zhǔn)),全部無費用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目。一站式解決問題。近年來,隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展和普及,單細胞測序技術(shù)發(fā)展十分迅速。上海市small RNA高通量測序服務(wù)生工人、大、小鼠全基因組測序,項目介紹:人或者大、小鼠全部基因組重...

    2022-09-22
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海市靶向捕獲高通量測序技術(shù)
    上海市靶向捕獲高通量測序技術(shù)

    細胞質(zhì)檢時染料染色的原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一種小分子染料,可以通過完整的細胞膜,嵌入所有細胞(活細胞和死細胞)的細胞核,呈現(xiàn)綠色熒光;碘化丙啶(PI)只能通過不完整的細胞膜,即死細胞的細胞膜,嵌入所有死細胞的細胞核,呈現(xiàn)紅色熒光,通過標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細胞和死細胞,這種特異性染色的方法也可以排除無核細胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。請注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。上海市靶向捕獲高通量測序技術(shù)對于細胞樣...

    2022-09-22
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海small RNA高通量測序技術(shù)
    上海small RNA高通量測序技術(shù)

    對于微生物樣品,請客戶如實聲明所屬物種;對于可能致病的微生物,生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來,用干冰寄送;以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品,用RNA組織保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;沒有RNA組織保存液的情況下,也可用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達到100 mg/樣;細菌樣品送樣量需至少達到107(10的7次方)數(shù)量級,同時,在與樣本一同寄送的送樣表上,標(biāo)明屬于革蘭氏陽性菌(G+)還是革蘭氏陰性菌(G-)。單細胞測序到底是什么?上海small RNA高通...

    2022-09-22
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海市宏全基因組高通量測序高通量
    上海市宏全基因組高通量測序高通量

    IlluminaHiSeq2500/4000可以運行PE150/PE250模式,可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測序、人基因組重測序、外顯子捕獲測序、宏基因組測序、微生物分類測序等服務(wù);IlluminaMiSeq運行PE300模式,可以承擔(dān)細菌基因組重測序/Denovo測序、微生物分類測序、擴增子測序、核酸適配體測序等服務(wù);LifeIontorrentPGM運行314、316、318芯片,可以承接擴增子測序、靶區(qū)域測序、基因組重測序服務(wù);PacBioSequel/RSII該測序平臺讀長超長,平均可達10kb以上,主要承接細菌基因組完成圖測序、***基因組精細圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序等服務(wù);生工生物已開展10x單細...

    2022-09-22
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • ITS高通量測序服務(wù)
    ITS高通量測序服務(wù)

    土壤樣本請置于2 mL離心管里(多準(zhǔn)備幾管備用),為保護樣本管,樣本管置于保護用的50 mL離心管或其他類似容器里,并旋緊蓋子;如常溫采的樣品,可以采用藍冰運輸;如果是高溫發(fā)酵罐或者樣品已經(jīng)凍存-80°C,需要用足量干冰運輸; DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子;藍冰運輸;RNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子;用足量干冰運輸。 生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準(zhǔn)),全部無費用。ITS高通量測序服務(wù)生工靶向捕獲測序,項目介...

    2022-09-21
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海SNP高通量測序測序
    上海SNP高通量測序測序

    RNA類高通量測序樣品要求:對于需要進行 RNA 抽提的樣品,請使用新鮮取樣的實驗材料,當(dāng)場分成小塊(動物樣品厚度需小于0.5 cm,植物樣品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗,在秋冬季節(jié),如果打包合適,5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時,而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些)中用保溫箱寄送。一般組織樣品,送樣量至少200 mg/樣;如果樣品屬于孢子,送樣量至少500 mg/樣。KBSeq全質(zhì)粒測序?qū)τ跇颖镜牧浚蟮囊脖容^少。上海SNP高通量測序測序生工CHIP-Seq,項目介紹:CHIP-SEQ 技術(shù),即染色...

    2022-09-21
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 單細胞測序高通量測序測序
    單細胞測序高通量測序測序

    單細胞測序是什么?單細胞測序是基于高通量測序(Next-generationsequencingtechnology,NGS)方法,檢測群體中單細胞基因組、單細胞轉(zhuǎn)錄組、單細胞表觀基因組及單細胞蛋白組,提供細胞間差異的高分辨率視圖,從分子水平揭示細胞奧秘。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(Single-cellRNA-Sequencing,ScRNA-Seq)指在單細胞水平上對mRNA進行高通量測序和分析的技術(shù)。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序能獲得單個細胞內(nèi)近萬個基因的表達信息,為辨別生物組織中各種細胞類型的轉(zhuǎn)錄組特征和全方面揭示細胞之間基因表達的異質(zhì)性提供了有力的工具[3]。說到細胞異質(zhì)性(Cellheterogenei...

    2022-09-21
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海SNP高通量測序服務(wù)
    上海SNP高通量測序服務(wù)

    2021年11月1日,在這個平凡而又特殊的日子里,生工生物高通量測序部迎來了一位新成員——10xGenomics Chromium X!不要看我們個頭小,我們可是百萬級單細胞捕獲神器吆。X是如何實現(xiàn)單次運行有這么高的吞吐量呢?多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個通道(Controller為8通道),每個通道比較多捕獲20000個細胞(Controller為10000個細胞)。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù),每個通道比較多可捕獲60,000個細胞,去除雙細胞率后,每張芯片比較多可捕獲750,000個單細胞。KBSeq全質(zhì)粒測序只能測菌液和質(zhì)粒,...

    2022-09-21
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海宏基因組高通量測序項目
    上海宏基因組高通量測序項目

    通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢能觀察到懸液背景質(zhì)量和細胞數(shù)目及活性的評估。讓我們再來回顧一下臺盼藍染色原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。怎樣通過血球計數(shù)板進行質(zhì)檢操作呢?將血球計數(shù)板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計數(shù)板上;將細胞懸液混勻(或10μl臺盼藍+10μl細胞懸液),吸出10μl懸液至計數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細胞核懸液鋪滿蓋玻片和計數(shù)板之間;在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個計數(shù)區(qū)域進行計數(shù);按細胞計數(shù)公式進行計算,計算公式:細胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10...

    2022-09-21
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海羥甲基化測序高通量測序產(chǎn)品
    上海羥甲基化測序高通量測序產(chǎn)品

    生工高通量測序樣品要求,RNA樣品:請?zhí)峁舛取?50 ng/μl、總量≥2μg的總RNA樣品,樣品請去蛋白并進行DNase處理;請務(wù)必提供每個樣品具體的濃度、體積、制備時間以及物種來源。比較好附上QC數(shù)據(jù),可以是電泳膠圖、分光光度值、Nanodrop儀器檢測數(shù)據(jù)或者Agilent Bioanalyzer儀器檢測數(shù)據(jù)等;一般情況下,轉(zhuǎn)錄組測序需要Agilent Bioanalyzer儀器檢測獲得的總RNA 28S:18S≥1,RIN≥7;小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒,可選擇傳統(tǒng)總RNA提取法(如乙醇沉淀、異丙醇沉淀等)或者選用專門的小RNA提取試劑盒;寄送RNA樣品請置于1...

    2022-09-20
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海地區(qū)生工高通量測序應(yīng)用
    上海地區(qū)生工高通量測序應(yīng)用

    真核/原核無參mRNA-Seq,項目介紹;測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進行拼接,并進一步對拼接所得轉(zhuǎn)錄本進行功能注釋、CDD、CDS分析,SNP分析,SSR標(biāo)記開發(fā)等分析。在計算基因的表達量后,進行基因表達差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對于多個樣本,可進行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外,還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機理提供方向。 特別申明:不能采用過柱離心的方法提取總RNA。上海地區(qū)生工高通...

    2022-09-20
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海多重PCR高通量測序公司
    上海多重PCR高通量測序公司

    轉(zhuǎn)錄組測序,項目介紹:RNA-Seq,是基于新一代測序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法:首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進行 mRNA 富集,然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進行新一代高通量測序,在此基礎(chǔ)上進行短片段拼接組裝,從而獲得一個個單獨轉(zhuǎn)錄本,進而可以對該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達狀況有全局了解。對不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進行 比較分析,則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達水平的變化,針對關(guān)鍵基因則可以進行代謝通路(Pathway)的構(gòu)建。小RNA測測序不可采用常規(guī)柱式總RNA提取試劑盒。上海多重PCR高通量測序公司small RNA測序,項目簡介:Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長...

    2022-09-20
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海地區(qū)微生物高通量測序產(chǎn)品
    上海地區(qū)微生物高通量測序產(chǎn)品

    生工優(yōu)勢:1.生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。2.生物信息分析經(jīng)驗豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報告模板為準(zhǔn)),全部無費用。3.生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目。一站式解決問題。請?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運輸,不超過3天。上海地區(qū)微生物高通量測序產(chǎn)品單細胞轉(zhuǎn)錄組測序中,制備高質(zhì)量...

    2022-09-20
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • ITS高通量測序高通量
    ITS高通量測序高通量

    使用顯微鏡進行懸液質(zhì)檢操作時應(yīng)注意:1.使用血球計數(shù)板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層,則需要多次清洗,直至計數(shù)室潔凈無瑕;2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口***頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數(shù),一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數(shù)目過多,難以數(shù)清,應(yīng)當(dāng)對細胞懸液進行稀釋以便于計數(shù);5.對于壓在方格界線上的細胞應(yīng)當(dāng)計數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細胞數(shù),一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線,數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理,另兩邊不計數(shù)。ChIP項目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0檢測為準(zhǔn)。其余具體咨詢生工高通量測序部。ITS高通量測序高通量如果你的...

    2022-09-20
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海市多重PCR高通量測序原理
    上海市多重PCR高通量測序原理

    KBSeq全質(zhì)粒測序跟一代測序相比有什么優(yōu)點呢?一代測序:1.數(shù)據(jù)質(zhì)量,套峰,雙峰等情況,需要人工分析校對。2.測序長度,1 kb。3.成本,低。4.樣本用量,100 ng。5.精確度,70-90%。6.測序能力,需要測序引物,只能測測序引物間的片段序列。7.通量低,(與讀長有關(guān))。8.實驗周期,如果片段長度超過5K,測通可能需要15天左右。對于測序長度較長,如果我們用Sanger測序往往需要花費大量的時間,而我們KBSeq全質(zhì)粒測序則只需要5-7天,就可以測通片段長度小于30kb以下的片段。KBSeq全質(zhì)粒測序?qū)τ跇颖镜牧浚蟮囊脖容^少,比如質(zhì)粒我們的樣本要求DNA的濃度需≥ 1 ng/μ...

    2022-09-19
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海市16s高通量測序應(yīng)用
    上海市16s高通量測序應(yīng)用

    使用顯微鏡進行懸液質(zhì)檢操作時應(yīng)注意:1.使用血球計數(shù)板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層,則需要多次清洗,直至計數(shù)室潔凈無瑕;2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口***頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數(shù),一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數(shù)目過多,難以數(shù)清,應(yīng)當(dāng)對細胞懸液進行稀釋以便于計數(shù);5.對于壓在方格界線上的細胞應(yīng)當(dāng)計數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細胞數(shù),一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線,數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理,另兩邊不計數(shù)。10xGenomics Chromium X多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。上海市16s高通量測序應(yīng)用s...

    2022-09-19
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海羥甲基化測序高通量測序項目
    上海羥甲基化測序高通量測序項目

    對于用RNA組織保存液寄送的樣品,請按照RNA組織保存液說明保存和寄送。請注意:1)樣品浸入組織保存液之前,對于動物組織樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.5cm的碎塊;對于植物樣品,須以建議快速度將樣品剪切成厚度小于0.3cm的碎塊。2)鼠肝、腎和脾等小organ樣品和沒有蠟質(zhì)保護層的植物樣品可不剪切直接放入保存液中保存,有蠟質(zhì)保護層的植物樣品需要先將蠟表皮破壞。3)確保將樣品完全浸泡在保存液中,不讓其粘貼在管壁和蓋上。高通量測序技術(shù)是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。上海羥甲基化測序高通量測序項目樣本寄送時,請將填寫完整的紙質(zhì)版《高通量測序送樣表》密封于塑料袋內(nèi),隨樣本一...

    2022-09-19
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海地區(qū)16s高通量測序
    上海地區(qū)16s高通量測序

    單細胞測序技術(shù)的應(yīng)用:單細胞測序技術(shù)可以檢測復(fù)雜組織中單個細胞不同的生物學(xué)特性,這可以極大的幫助我們進一步了解細胞與細胞之間的差異。"這幾乎就像通過幾顆星星看到了整個宇宙。"哈佛大學(xué)分子和細胞生物學(xué)教授 Alexander Schier的這句話應(yīng)用在這里也是很合適了。這幅圖正是來自于在2018年4月 Science 雜志發(fā)表的三篇[8-10]來自哈佛醫(yī)學(xué)院和哈佛大學(xué)的研究人員關(guān)于單細胞基因測序文章中的一幅結(jié)果圖,Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。這幾篇文章使用多種檢測技術(shù)組合,其中包括對數(shù)千個發(fā)育中的斑馬魚和青蛙胚胎單細胞測序,在胚胎發(fā)育建議初的24小時內(nèi)追蹤單個細胞...

    2022-09-19
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海宏全基因組高通量測序NGS
    上海宏全基因組高通量測序NGS

    使用顯微鏡進行懸液質(zhì)檢操作時應(yīng)注意:1.使用血球計數(shù)板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數(shù)室內(nèi)是否潔凈無雜質(zhì)。若有雜質(zhì)灰層,則需要多次清洗,直至計數(shù)室潔凈無瑕;2.質(zhì)檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口***頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數(shù),一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數(shù)目過多,難以數(shù)清,應(yīng)當(dāng)對細胞懸液進行稀釋以便于計數(shù);5.對于壓在方格界線上的細胞應(yīng)當(dāng)計數(shù)同側(cè)相鄰兩邊上的細胞數(shù),一般可采取“數(shù)上線不數(shù)下線,數(shù)左線不數(shù)右線”的原則處理,另兩邊不計數(shù)。近年來,隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展和普及,單細胞測序技術(shù)發(fā)展十分迅速。上海宏全基因組高通量測序NGS 土壤樣本請置于2 mL離心...

    2022-09-19
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 無參轉(zhuǎn)錄組高通量測序測序
    無參轉(zhuǎn)錄組高通量測序測序

    擴增子測序,項目介紹:隨著基因編輯技術(shù)(尤其是CRISPR-cas9技術(shù))的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測序技術(shù)無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過對靶基因區(qū)域附近設(shè)計引物,進行PCR擴增,并對PCR產(chǎn)物進行高通量測序,可以快速高效的獲得目標(biāo)區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠遠優(yōu)于一代測序,性價比極高。16S全長分類測序,項目介紹:16S全長測序分析主要是對 16S rRNA基因全長進行擴增,基于PacBio 測序平臺測序. 相比較二代測序只選擇 1-2 個高變區(qū)進行測序,三代可以獲得全長的 16S 序列,更多變異區(qū)信息可以提高物種鑒定的分辨率,還可以提高對于群落組成...

    2022-09-07
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海市靶向捕獲高通量測序
    上海市靶向捕獲高通量測序

    真核/原核無參mRNA-Seq,項目介紹;測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后進行拼接,并進一步對拼接所得轉(zhuǎn)錄本進行功能注釋、CDD、CDS分析,SNP分析,SSR標(biāo)記開發(fā)等分析。在計算基因的表達量后,進行基因表達差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對于多個樣本,可進行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外,還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機理提供方向。 關(guān)鍵是KBSeq還可以省錢。上海市靶向捕獲高通量測序長鏈非編碼...

    2022-09-06
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海地區(qū)宏全基因組高通量測序
    上海地區(qū)宏全基因組高通量測序

    細胞質(zhì)檢時染料染色的原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一種小分子染料,可以通過完整的細胞膜,嵌入所有細胞(活細胞和死細胞)的細胞核,呈現(xiàn)綠色熒光;碘化丙啶(PI)只能通過不完整的細胞膜,即死細胞的細胞膜,嵌入所有死細胞的細胞核,呈現(xiàn)紅色熒光,通過標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細胞和死細胞,這種特異性染色的方法也可以排除無核細胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。請寄送樣本(尤其是細胞樣本)之前鑒定樣本所屬物種。上海地區(qū)宏全基因組高通量測序?qū)τ诩毎麡悠罚?..

    2022-09-06
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海市全質(zhì)粒測序高通量測序技術(shù)
    上海市全質(zhì)粒測序高通量測序技術(shù)

    簡化基因組測序,項目介紹:通過限制性內(nèi)切酶對基因組DNA進行酶切,并對酶切片段進行高通量測序,這種通過酶切降低基因組的復(fù)雜度的測序技術(shù)統(tǒng)稱為簡化基因 組測序技術(shù)。利用生物信息學(xué)方法,進行SNP單體型圖譜繪制,全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),連鎖分析和QTL定位分析,種群進化,主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測序,項目介紹:宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA,隨后進行大規(guī)模高通量測序(shotgun 策 略)。測到數(shù)據(jù)后,先進行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控,而后進行基因組拼接、注釋(物種、基因功能),使得我們可以獲取環(huán)境樣品...

    2022-09-06
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • ITS高通量測序平臺
    ITS高通量測序平臺

    懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運作的呢?單細胞懸液質(zhì)控要求:?細胞濃度:700-1200cells/μl;?細胞活率>80%(當(dāng)細胞懸液活率低于70%時建議進行去除死細胞處理);細胞團及碎片雜質(zhì)<5%(無細胞粘連,無明顯的細胞碎片和細胞團,并保證細胞的完整性);?細胞狀態(tài):細胞直徑在7-40um之間(細胞直徑過大則建議進行抽核處理);?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細胞的核酸分子。KBSeq全質(zhì)粒測序只能測菌液和質(zhì)粒,像PCR產(chǎn)物什么的還是送一代測序吧。ITS高通量測序平臺small RNA測序,項目簡介:Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,...

    2022-09-06
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海市基因組高通量測序NGS
    上海市基因組高通量測序NGS

    土壤樣本請置于2 mL離心管里(多準(zhǔn)備幾管備用),為保護樣本管,樣本管置于保護用的50 mL離心管或其他類似容器里,并旋緊蓋子;如常溫采的樣品,可以采用藍冰運輸;如果是高溫發(fā)酵罐或者樣品已經(jīng)凍存-80°C,需要用足量干冰運輸; DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子;藍冰運輸;RNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子;用足量干冰運輸。 寄送 RNA 樣品請置于 1.5 ml 離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用 Parafilm 封口。上海...

    2022-09-06
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • ITS高通量測序應(yīng)用
    ITS高通量測序應(yīng)用

    單細胞懸液質(zhì)檢方法,在進行單細胞懸液質(zhì)檢時,需要用到以下兩大質(zhì)檢利器的輔助:熒光細胞計數(shù)儀(主要使用臺盼藍和雙熒光AO/PI染色法)進行質(zhì)檢。首先我們先要了解一下細胞質(zhì)檢時染料染色的原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。熒光細胞計數(shù)儀檢測結(jié)果可以讓我們直觀的看到:細胞濃度(總細胞,活細胞,死細胞)、細胞存活率(臺盼藍和雙熒光AO/PI染色)、細胞平均直徑、細胞聚團率、細胞直徑分布等結(jié)果的展示。對于需要進行RNA抽提的部分特殊樣品,可以將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送。...

    2022-09-05
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海市靶向捕獲高通量測序平臺
    上海市靶向捕獲高通量測序平臺

    臺盼藍染色原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。 通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢得到質(zhì)檢結(jié)果:明場(細胞未染色):主要可以觀察懸液背景質(zhì)量(背景干凈,無雜質(zhì)碎片,無細胞團塊);臺盼藍場(細胞與臺盼藍染色后):主要可以觀察活性(主要為活細胞,未染色藍色的為活細胞);通過臺盼藍場計算活率:90%>80%;細胞濃度:710cells/μl;等結(jié)果來看,血球計數(shù)板質(zhì)檢結(jié)果的展示可以看出所有指標(biāo)均符合上機標(biāo)準(zhǔn),屬于高質(zhì)量單細胞懸液。 使用足量的干冰運輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸...

    2022-09-05
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海市單細胞測序高通量測序平臺
    上海市單細胞測序高通量測序平臺

    全轉(zhuǎn)錄組測序(Total RNA-Seq),項目介紹:全轉(zhuǎn)錄組是指特定細胞在特定狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA(non-coding RNA)。針對非編碼RNA的研究主要集中在具有調(diào)控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。基于二代測序技術(shù)的全轉(zhuǎn)錄組測序研究,同時分析同一樣本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通過關(guān)聯(lián)分析,使研究內(nèi)容更加系統(tǒng)化,致力于深入挖掘生命現(xiàn)象背后的轉(zhuǎn)錄調(diào)控問題。組織樣品或者總 RNA, 樣品名稱清晰,干冰運輸。寄送RNA樣品請置于1.5 ml離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Para...

    2022-09-05
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 上海市靶向捕獲高通量測序高通量
    上海市靶向捕獲高通量測序高通量

    生工外顯子測序,項目介紹:已知人類基因組上有180000個外顯子,占整個基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負責(zé)編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復(fù)雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測 序,全外顯子捕獲測序有測序深度高、價格便宜的優(yōu)勢,性價比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報告。特別申明:不能采用過柱離心的方法提取總RNA。上海市靶向捕獲高通量測序高通量懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備...

    2022-09-05
    標(biāo)簽: 高通量測序
  • 單細胞測序高通量測序平臺
    單細胞測序高通量測序平臺

    核酸適配體測序,項目介紹:核酸適配體是一類能夠特異性地和靶物質(zhì)結(jié)合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白質(zhì)、金屬離子、小分子化合物、細胞膜表面受體等靶標(biāo)。其結(jié)合能力可與抗體相當(dāng)甚至更強,同時具有低免疫原性、 穩(wěn)定性好等特點,并可結(jié)合各種藥物及載體構(gòu)建多元復(fù)合靶向給藥系統(tǒng)用于tumour靶向treat, 在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有潛在高價值。生工生物針對核酸適配體特殊結(jié)構(gòu),結(jié)合Illumina MiSeq測序平臺,可以快速對核酸適配體文庫進行大規(guī)模高通量測序,省去克隆測序的麻煩,提高測序深度,快速計算適配體序列頻率,方便科研客戶快速評估序列富集程度。單細胞測序技術(shù)可以檢測復(fù)雜組織中單個細胞不同的生物學(xué)特性.單細胞...

    2022-09-05
    標(biāo)簽: 高通量測序
1 2 3 4 5 6 7